EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR002-19773 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_24hpf 
Coordinate
chr17:25180628-25182050 
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
HOXA13MA0650.2chr17:25181616-25181627GTTTTATTGGG-6.62
HOXB13MA0901.2chr17:25181616-25181627GTTTTATTGGG-6.62
HOXD13MA0909.2chr17:25181616-25181627GTTTTATTGGG-6.62
HOXD9MA0913.2chr17:25181422-25181432GCAATAAAAC+6.02
Enhancer Sequence
AAAAGAACTA ATGCATTTTA GGTGAAGTTA TGTGCAAATA CTTTTTTTCA ATAATAAGGG 60
AATTATGAAT TCAATTAAAG CTAAAATAAC TCAATTTATT GTTACAAATA GCAAATGCCA 120
CAGATGCTTA TCACTGTGTC CTTCTATATG AGGCATAAAT TCAGAATTTG ACCCTTCATT 180
CTTGAACGTA CGGTTCTCAT CCTTCAAGTA GACAATCTGT ACTACAGCTG AAGGTTAATC 240
TCTTCATTGT GCCTGCAGTC AAGAAGTTTG CTAAATAAAC CTTAGCAACA TGCCTTTTTA 300
AAAATTCATA CCTCTCTTAT TATACATGGA TCAAATGGTC TAAAACATTT AAGGAATGCT 360
ATTTTTAATT AGTGAAGCTT TTCCACTTCC CCAAAGTTTT ACTGCATCAT TTCCTTCCCC 420
GGGAGCTTCA GTCCTTTCAG GAATCTGAGG CCCTCTGGCC TTTCTCTAGA TGAGTGTGTG 480
TGATACGGGG GAAGAGCTCT CATGTGCGAC TGCATTGTTT GGCTCCATGC TTGTCCAATT 540
CACTTTGCAT CAGAGAGCAG GATTTGCTCA GATTGCTGGC AATTTGCTTA GCAAATAGCC 600
ACACCACAGG AGCAGGGGCT TCTCCACTCA CAGTGATCTG CTCTGTAAAT AAAGCCTGTG 660
GATTACATGC TTTTGAAGGC TTGCAGAACA TATCCTGAAG CTTATTGGTT CAAATAACTA 720
ACCTTTTTTT GTAACCCGTC AACATCTCCT TAGATTTTTT GCAGTATAGT GCTCCACATG 780
GCAGACGTTG ATGTGCAATA AAACTGTTTA GAGACGGATT ATGTCATACG TGGGCAATTC 840
AGCGTGGTGT GGCATGGCTT TCTTAAAGGA GTTTGAAGAG AAAATGGAAT TTATGGCTGA 900
GGGACTTTGA ATGGGAGAAA AAAAAACCTC TTTGTTGGCT ATATCCTTTG AGTTGTTTCG 960
TTGTGCTAGC CGAGTTGGAG CAGATGGGGT TTTATTGGGT GATCTAATGT TGTGGTCAGG 1020
CAATGCACTT GGGAATCTAT GTTTGTTAAT TGTTAGAGCT CCCATGTCCA TGTATGAGCT 1080
TTTGTGTCCT GTGAAGGATT ACTGAAAACT GCTGAGAATC TACAGAGATG CCAAATGTGC 1140
TGTAATGTTG AGCTATGCAG CTTCGCCTCT TTTATTTCAG TTAACCAATA CGAATTTGTC 1200
TTCTCTATAA CCGTTAAGTT TAACCAATAT GCTGATGACT TTTGTTTTAC TTTAGTGAAC 1260
ATAAAACAGG CTTTTCAGAC TGTACATAAC CCTGGGTTAT TGTCTTTCTG AACACAGTTT 1320
TTAACCCTGA GTAAAGACTC ATTTCACACA TGTCATTTTC CATAGCAGGG TTAACGCCAC 1380
ATTTGTGGTG TTAACCCTGC ATTGCTGTGT TAAGTTTGTT CT 1422