EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR002-18073 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_24hpf 
Coordinate
chr16:39732590-39734628 
TF binding sites/motifs
Number: 21             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
LMX1BMA0703.2chr16:39734575-39734586AATTTAATTAA+6.32
LMX1BMA0703.2chr16:39734578-39734589TTAATTAAATT-6.32
Lhx3MA0135.1chr16:39733446-39733459GGTAAATTAATTT-6.07
NFYAMA0060.3chr16:39733594-39733605AGCCAATCAGA+6.32
PBX1MA0070.1chr16:39733062-39733074CCATCAATCAAA+7.22
PHOX2AMA0713.1chr16:39734574-39734585TAATTTAATTA+6.62
PHOX2AMA0713.1chr16:39734579-39734590TAATTAAATTA-6.62
POU4F1MA0790.1chr16:39734605-39734619ATAAATAATTAATA+6.29
POU4F3MA0791.1chr16:39734605-39734621ATAAATAATTAATAAA+6.44
PROP1MA0715.1chr16:39734579-39734590TAATTAAATTA+6.32
PROP1MA0715.1chr16:39734574-39734585TAATTTAATTA-6.32
PROP1MA0715.1chr16:39734574-39734585TAATTTAATTA+6.62
PROP1MA0715.1chr16:39734579-39734590TAATTAAATTA-6.62
Phox2bMA0681.1chr16:39734574-39734585TAATTTAATTA+6.62
Phox2bMA0681.1chr16:39734579-39734590TAATTAAATTA-6.62
ZNF384MA1125.1chr16:39734023-39734035AAAAAAAAAAAA+6.22
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ZNF384MA1125.1chr16:39734022-39734034TAAAAAAAAAAA+6.37
Enhancer Sequence
GGGGGAAAAG CTGGCCGCTT AGACCCATAT TGGACTGGAG CAGATAAACA ACGCTCATAT 60
ACTGCAGCTT TTTTGGGCGC CAAGTTTTCC TCAGTGGGGG AGAAAACCTG GAGACTGGTG 120
GGAAAACCAT CGACCTAACC TACGTGTGGC TGGACACTCT ATCTAGTTAA TGTGGACCCC 180
TGGGGTTGCA TATTGAAATA CGCCTTCATG AGAGAGTGCA GCCAAAGTCA TAGCGGCTGC 240
CAGCTCCTCA TAATGGGCGC TCACGGTCTG GTCGGTATCT GGGCACGCTT CCCTGAACCG 300
CCACGTCATG CCAGCAGCTG GGGCTGCCCA GAAAATGCCA GTTGTTCACC CGCCGCCATT 360
TTCCCATCAG CCAGCCCAGA CGGCGAGACT TGCTTCGCGG GAATAAAAAC AGGAGAGGAG 420
AGATTAAAGG ACTTGAGAGA AAGACTGGGA ACTTAAACGT GGCCAGATGA CTCCATCAAT 480
CAAATGTTTT CTCACACCCC CCATTCTCTT TTCTTGTGTT GTGCAGTTGA AACAAAGGAA 540
TTATTCCCTT CTACACATTT GGTGTCTTGG TAAAATAGGA TGGAAACTCG GATTGAAAAG 600
ATTCAGGATT GTGTGTCACT TAGAATTGAA TTGACATTAC CCTTTAAATC TCTTTTTTAT 660
ATTCAAAATG ACTTAATTTT GATAGAAACT TTATGCCAAC TTTGACAAAA TTTATGTTCC 720
ATTCAGAGAA TCATTATTGG AGATTTTAAA AGTTTAGGCT TGGTGCGATA GTTAATAGCC 780
CCTTTCACAC ATGCAGACCC TTCTGCAATT TTCCAGAAAG GTCTGGATTT GTGAACAGGC 840
ACTTTTTGAA AATAACGGTA AATTAATTTC TGCAAATTTC CAGAAAGAGA AGTTGTAACA 900
TTAACGGTAA TTTGCTGGAA TACTGCTCTG TGTGAACGCA GAAGAAAAAT TGCCGGAAAG 960
AGCATGTTCA CTATTAGAAA GCACTGATGA GAGACATCTA TTCCAGCCAA TCAGAACACT 1020
CAGACGCATT CACATCTGTG CTGGTTATGA AATAAAAGCC TTTGAATATT TTTTAAGACA 1080
CATTCGGCTG CTAGATGTTA GTCAAATAAG TTTCTATGTT TCCTTCTTAA TGCCAACTAT 1140
GGAAAAAATT ATTGATAAAA TGCTTCTGAT AAACCGCTGT TTATTTACCT TCAAGCTCTG 1200
CTTCAGTTGT TTAACGCGTG TGCACGTCAA GTGCTCCAGT GAGCGCCAGC ACACACACAT 1260
ATTATGTATA TCTCGACATG TCAAAGCGTT CCTCCATATG TTTTCGTCGA AGTTGTTAAC 1320
AATGCTTATC CATTCACAAA GTTTGTGATG TAGTTAAATG CGTAAACATG TAGCAGGGGT 1380
TAGTGCTTCT GCGTTTGGAT GTCTCTGGGA CAAAAAGCAG CTGCATAAAT GCTAAAAAAA 1440
AAAAAAAAAG TGAAATCATT ATCATCAACA TCCTTGCCTG TGTGAACAGC GCTTTTTTGA 1500
ATTAAAGTCA TTCAGTAAAC TTTACAGATA TTTATTGGTA TCACTGTGTG AAAGGTGCTT 1560
ATGTTACCAA TTTTGTCACT TGCCCACCAC GTCACCGCCA TCAACGTCAT TTTGATTTTT 1620
TAATAGTAAT AAATATCATT TAGTTGTGTA AGAGAAAATA CACTACAGTA TAAAAATGAA 1680
AGATTTCGAT CACAGATCAG CAGGAGTAAG ATTTCATTTA TCAGTGAGTC AATGACTGGC 1740
CGATTTAAGT ACTAGAGGAT GAGTTTTGTG CTGCAGAGCG CGTTTCGCAC ATCATCAAAT 1800
CATCACCATA GTTACAATCA ACAAGATCAA AGTTGTATTT GCTAAAATAT AAACAGTATC 1860
ATGAACATGA CCAGAATATT TTCATGTCAG AGTAATTTGC ACATACTATT TGAATTTTTA 1920
CCTGGCAAGA GCACTTGTAA GTACACTCAA ATTATAATGT TGAACCCAAT TGCTAACTCT 1980
AAAGTAATTT AATTAAATTA TGAAATAAAA TAAAAATAAA TAATTAATAA AATAAATA 2038