EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR002-17014 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_24hpf 
Coordinate
chr16:20257218-20258760 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
IRF1MA0050.2chr16:20258169-20258190TTATGGTTTCTTTTTCTCTTG+6.07
NEUROD1MA1109.1chr16:20257531-20257544AAACAGATGGCAT+6.01
PBX2MA1113.1chr16:20257462-20257474GTGATTGACAGC+6.92
Enhancer Sequence
GGGGGGCAGA GCAGGATTCT CCCGATGAAC ACTGGCGAAA TTTTTTGTCA TAAGCCGCAT 60
CAGTTTAAAC TTAGTAAAGG CGAGCTTCTT GGGCGATGGT GTTAGATTTT ACATTTAGTG 120
AACATTTGGG CTGAACACGC AGTGAATGCA ACGCACCTAG ATTAGGTGTA CTTTTCACTC 180
TTCAGTCGTT TGCATTCGTT GTGGTAACAA AAGCTCCCTA TCATTTGACA GCGGAAAGTC 240
TTGAGTGATT GACAGCTGAT ATGAACTGAT ATAGCGGCAG GGAAAAGCGA TTTTTAGAAA 300
AAAAACAAAA AAAAAACAGA TGGCATTACA ACCATTATAT GCAGTCGCAC AAATGCTCCC 360
AAATATATCA TATGGTAGCA TAGCTTAAAT TTTGGGCGCA TATGCGACAT GCATATGCGA 420
TAATAACTGC AGATCAATAG CCTACTGTAA CGTCTGCGAT TACATAAAAT GAATAAATAA 480
ATAAAAGCTA CAAATATGAA TGCAAACAGC TCCTTACAGC CACGATATGC TGCTACCAAT 540
TACAGAAAAA CTACACACAG CATACATTTA GTTCTTATTT GCATCATCAT AGCAAAGATA 600
AAAGAAATAA GTTATTAGAA ATGAGTTATT AAAACTATTA TGTTTAGAAA TGTTTAAACA 660
AATTCTTCAT TAAACAGAAA TTGGGGGAAA GGGTTGCTAA TAATTCAGGA GGGCTAATAA 720
TTGTGACTTC AACTATAGTT ATTTTCCTCC CTGCAAAGGG AAATAAATAC AATAAAAGAA 780
AAATATTAAA CAAACTCTGC TTTAGGCATC TTCACTGTAA GAAAAACACT TTAGCTACAA 840
AAGTCCTTTA GTCAAGATCA GTGAGAGATT TTGTTGTTTG ATTAATAATG ATATAAACAG 900
GAAGCAGCAG GAATATTGCG CGCTGTCACT TGAAGACCAG TACGGTTCAG TTTATGGTTT 960
CTTTTTCTCT TGTCTTTTGA TTCTCAACTC GTTCGTTTAT TATACAAATG AGGGTTAATA 1020
TGAATAATCA CTAAACAACG CGTTTTGACA CCTATTTGAC TTTTAAAGCG CTCACATTAA 1080
GATGACTTTA GATGTGTGTG CTCTGCTTGT CTCTGAGGCT TAGCGCACTT ATTGTGCGAA 1140
TTAGACTGAA TGCTCTTTTA GGGTGCTTTC ACACTAGCAC TTTTGGTCTG CACCCGGGTT 1200
CATTTGACAT CATAGTATGG TACGTAAGCT AGTTTAGCGT GTCCTCTGAA CTCTGTTTCA 1260
CACCCGTGAA CTGTACCCAT GTCTGCCTTA AAGAGGTGGT CTGGGTTACA GTTCGTGCTA 1320
TTTCTTGTAC GGTTCACTTC TGATAAGAAT GCAGTCGTAC CAAATAATGT AAGTGAACCG 1380
CTAACTTTAC AACAAACTAT CGTTTTCAAA ACGTGTGTGT GTTTCTGTGT CATGTTTCTA 1440
ACCTTAGTGA CACGTGCGGG ACCGAGCCAG GGCAAACACA GTGACGTCTG CTAGTCTCCT 1500
CCAAAAAAGC TTTTGCAGAC ACTGTGTGAT GTTCTGAATG TT 1542