EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR002-16160 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_24hpf 
Coordinate
chr16:671831-672923 
TF binding sites/motifs
Number: 11             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
PAX3MA0780.1chr16:672165-672175TAATCGATTA+6.02
PAX3MA0780.1chr16:672165-672175TAATCGATTA-6.02
PAX6MA0069.1chr16:671908-671922AACTCATGCGTAAA-7.14
PAX7MA0680.1chr16:672165-672175TAATCGATTA+6.02
PAX7MA0680.1chr16:672165-672175TAATCGATTA-6.02
POU1F1MA0784.1chr16:672882-672896AATATGCTAATTAT+6.91
POU2F1MA0785.1chr16:672882-672894AATATGCTAATT+6.52
POU3F1MA0786.1chr16:672883-672895ATATGCTAATTA+6.44
POU3F2MA0787.1chr16:672883-672895ATATGCTAATTA+6.62
POU3F3MA0788.1chr16:672882-672895AATATGCTAATTA+7.04
RUNX1MA0002.2chr16:672182-672193AAACCACAAAC-6.02
Enhancer Sequence
AACTGCCGCA GTTTCAATTT GCCAGAACTT CATCTGAGCT AATCTACACT GTCAAAGCGC 60
TACAGAAAGA AAGATTGAAC TCATGCGTAA ACACAGAAGT GTATGTGTGC TTCAGAAGAG 120
CACCACAACA CTACAACCAC AGCGCTGAGC ACGAATGACG ACGAACAAAG CCCAGCGCGC 180
AGCTTTGAAG CATCGATAGT GTTCCTGCAA ACGAGGACGC TCTCCGCTAT CAAACCGCCG 240
CATAAAAGTC TCCCATGTAT CGCCGGGAAT CCGAGAGGCT TGAAAACCCA ATCCAATAAA 300
GGAAACAGAC GCCGGCAAAC AAAAGACAGA GGAGTAATCG ATTAGCACAT AAAACCACAA 360
ACGGAAAATC ATCACGCGGA GATGAGCGAC TGTGTCTTTA TAATTACACC TTAAAGCGCC 420
ACGCCGTCCC TACATATTCA TGAAGACAGA GCTGTAATTT GATAAAGGGC CGCGTGTGTT 480
GTGGTCTTGG AGGGGTATTA GAGTGGGCAT CTGTGTTCTG GCGGCATTAA TCTCCTGAAG 540
CAGATTTCTG CCGCTATGAT GTGCGGCACG GAGATAAGTC TTAAACAGTC TAGAGCTAAG 600
CAAACCCGAC AACTCTATTA TTGCCTTCAT AATTGCTTAA TTAAACTTTT GTCACTAATC 660
ATTACGGGGC CAATAGAGCT GTTATACAGA GGAAGACGGA GGAAAAAAGA ATCAATAAAC 720
CTCCCGAGTT AATTTCAGCC CGTTTTTTTC TCTCAGTATT TTATTTATTT ATTTTTTGTT 780
CTGCAAATGA AATGCATTGC TGCTGGTTAG TGATGTGTGT GGCTGCACGG AGGCTGATAT 840
GAGCTGCCAT CAGCATCTGA ATTGAGGGTA TTCAGTAGCA CATGAATATG AACAAATGGC 900
AAACATAAAT CTCCCGCATG AAGTACACCT TCCATCCCTT TATTGCAGAA CAATTGACCC 960
ATCCAGAATG AATTCTAATG CCAGGAAAGC ATTTAGATTT AAATTACACC GTGCTCTCGC 1020
CGACCTGAAA GATGACGGCA TAAAAAAGAT TAATATGCTA ATTATTTCCC CCCGCCGTAT 1080
TCCTCTTGTG GA 1092