EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR002-16065 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_24hpf 
Coordinate
chr15:47110950-47111845 
TF binding sites/motifs
Number: 15             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
HNF4A(var.2)MA1494.1chr15:47111498-47111513GGGTTCAAAGTTCAA+6.48
HNF4A(var.2)MA1494.1chr15:47111505-47111520AAGTTCAAAGGTCAC+7.23
HNF4GMA0484.1chr15:47111504-47111519AAAGTTCAAAGGTCA+7.07
HNF4GMA0484.1chr15:47111497-47111512AGGGTTCAAAGTTCA+7.64
Hnf4aMA0114.3chr15:47111498-47111514GGGTTCAAAGTTCAAA+6.98
NR2C2MA0504.1chr15:47111504-47111519AAAGTTCAAAGGTCA+6.06
Nkx3-2MA0122.3chr15:47111405-47111418ATAAACACTTAAA+6.71
Nr2f6MA0677.1chr15:47111505-47111519AAGTTCAAAGGTCA+7.12
RXRBMA0855.1chr15:47111498-47111512GGGTTCAAAGTTCA+6.91
RXRBMA0855.1chr15:47111505-47111519AAGTTCAAAGGTCA+7.14
RXRGMA0856.1chr15:47111498-47111512GGGTTCAAAGTTCA+6.96
RXRGMA0856.1chr15:47111505-47111519AAGTTCAAAGGTCA+7.12
RxraMA0512.2chr15:47111498-47111512GGGTTCAAAGTTCA+6.84
RxraMA0512.2chr15:47111505-47111519AAGTTCAAAGGTCA+7.12
TCF7L1MA1421.1chr15:47111504-47111516AAAGTTCAAAGG+6.37
Enhancer Sequence
TCAAAACACA TTAATACACA CTCATACACA CTCAAAACAC ATTAATACAC ACTCAAACAC 60
ACTCAAAACA CATTAATACA CACTCAAAAC ACATTAATAC ACACTCATAC ACACTCGAAA 120
CACATTAATA CACACTCAAA ACACATTAAT ACACACTCAA AACACATTAA TACACACTCA 180
TACACACTCA AAACACATTA ATACACACTC ATACACACTC AAAACACAAT AATACACACT 240
CAAAACACAT TAATACACAC TCAAAACACA CTCAAAACAC ACTAATACAC TTGTAATACA 300
CATACACAGC ACTTTAAAAC ACACAACAAA CATTGACACT TAAAACACAC AAAAAAACAC 360
ATAAAATTAA AAACAAACTT AGAACTCAGT GTCGTCAAAC TTAGTTTAAA CACACACACA 420
CAAGACATGC CCTCTTAAAA CACACACACA CACAAATAAA CACTTAAAAA CAAACTAAAA 480
ATGATCCAAA CACATCTCCA AAGCAATGAC AGAAAAACTG CATCCACTCA CCCAGCTGAC 540
TGACTCAAGG GTTCAAAGTT CAAAGGTCAC CATGGGTGTG TGTGTGTGTG TGTGTGTAAT 600
GTATAGCTTT AAGCGCAGCT CAGAGTCACA CAAAAACACA CACCAGAGTC GACAGAGCGT 660
CAGAATGAGA GAATGAGGGG TGGGCGAGAG CTGAGAGAGG CTGAGGGGGA GGGGCCTTGA 720
GGAAAGGGGG TGTGGTCATA TATAGCACTG GTGATGTCAC AGTCAGTCTG ATGCGCAAAC 780
ACACACACAG AGAAACACAC TGCTCTAAAG ATACTCAGCT GCTTATTAAC TTATCAAATC 840
ATTCAGAGAT TCTGCAGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTTTGCTCTC ATTCT 895