EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR002-14650 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_24hpf 
Coordinate
chr15:21003420-21004442 
TF binding sites/motifs
Number: 11             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
DBPMA0639.1chr15:21003534-21003546TATTACGTAATT-6.04
DMRT3MA0610.1chr15:21003507-21003518TTTGATACATT-6.02
DMRTA2MA1478.1chr15:21003506-21003518ATTTGATACATT+6.04
DMRTC2MA1479.1chr15:21003506-21003518ATTTGATACATT+6.74
HNF1AMA0046.2chr15:21004196-21004211TGTAAATAATTAATT-6.38
HNF1BMA0153.2chr15:21004197-21004210GTAAATAATTAAT+6.42
Lhx3MA0135.1chr15:21004202-21004215TAATTAATTATTA+6.18
Lhx3MA0135.1chr15:21004199-21004212AAATAATTAATTA-6.71
POU4F1MA0790.1chr15:21004197-21004211GTAAATAATTAATT+6.11
POU4F2MA0683.1chr15:21004197-21004213GTAAATAATTAATTAT+6.06
POU4F3MA0791.1chr15:21004197-21004213GTAAATAATTAATTAT+6.15
Enhancer Sequence
TTTGAATAAG TATTTATATG AATACAGTCA ATCTGCAGGA CTAGCTCTGC TGCAATACAT 60
ACCTAATACG TCATTTACCA AAGCCTATTT GATACATTTA GACGAAACAC AAGATATTAC 120
GTAATTCGTG AATCGCCTGG AAGCTTCCAG ATCTGGCGAG TAAATGTGTG TGAACGGCAA 180
AGCAAGAATG TGCAGAGCGA GCATTCAGAG CATTACTCAC CGGAGTGAGG AGACCATCCT 240
CCCCTTTACT GCCCGCTCCT TCAAGCAGAG CCCACCGTGA GAAACCCTCC ACACGACCCC 300
TCTGAACTCC TCCAGACCAC ACACGACAGT TCACCAGTGC TCAAAACAGC ACAGACGGGT 360
ACATTTTGCT TGCTTATGCC CTCGTATTAA TCCAAGCTCT TGACTTGTAG TCAAAGAAAA 420
ACGGTCGCTC ACTTTAAGGG TGACGTCGGC GAGCTTTTCT TTCATTTGAT TGGTCGGTCT 480
TGCTCTCGAA CGTCATCCTG ATGCCGCCGC CCACACGGTC GCCCTGGCGA CGGGAATAAA 540
CACTATTGAG ATTAGTAGTA CAAGTGCAAT GACAATAGTG CTTGATGGGA TTATTAAAGC 600
GATACTTTTA TAACAAACTA ATTTTATTCA CCCGCATGTA GCTGAAAATT CCTTCCGTGT 660
AATTAAATGT GTTTTTATGT ATTACTATAA AATATATTTT ATATATTATT TAATTAATGC 720
TAAAACAGAA ATGTGCTGAT TTACAGAAAA ACGCAACATT AAAAGTGGGT TTGTTCTGTA 780
AATAATTAAT TATTATTTAG GCATTTAGTA ATTATTTAGT AATTTAGGCA AAAGTAATTA 840
TATATATTAT ATATAGTATA TATAGTATAT ATATATATAT ATATATATAT ATATATATAT 900
ATATATATAT ATATATATAT ATATATATAT ATATATATAT ATAAAACTAA ATAGTTAGAG 960
AATAAAATAG CTATAACAAA TCAGAAATGT TGCCTTCACA AATAAATTGG GGAAGAAAAG 1020
TT 1022