EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR002-13896 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_24hpf 
Coordinate
chr15:3520233-3521366 
TF binding sites/motifs
Number: 6             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
RORA(var.2)MA0072.1chr15:3521247-3521261TTGACCTAATTATG-6.98
RORCMA1151.1chr15:3521248-3521260TGACCTAATTAT-6.74
YY1MA0095.2chr15:3520256-3520268CAAGATGGCGGC+7.22
ZNF384MA1125.1chr15:3520979-3520991TAAAAAAAAAAA+6.37
ZNF384MA1125.1chr15:3520978-3520990TTAAAAAAAAAA+6.44
ZNF384MA1125.1chr15:3520977-3520989TTTAAAAAAAAA+7.22
Enhancer Sequence
AAAGCCATTA CCCTGAGTCA ACACAAGATG GCGGCCATAC TCTAGCCAGA AACAGCAGCG 60
GGACACAGAA AGTAAACTAG CACAGGGCTC AAGGCGACAT CAATTGAACA AGGGCATCTA 120
TAAAGTATGA CATAAGAACA ATAGTAGTCA GGTCACACTC TGTCCTCAGA GAGACGACAC 180
TGCTGATTCA GCCCTCGCTC ATTTCAGCTC TTTCCTCGCA CCATTAAAAG GTTACCAGCA 240
CTCGGACCTT GCTTTCATTT TGTGGAGCTG CTCGTATTTA GTTACTGCTG ACAGTTATTG 300
ATAAAAGTCC TCTTACTGTA GTATAATAGA CCTATATAAT GGCATAAAAC AGCAGTTACT 360
GTCCAAAGTA ATCTTACTTT AATATAATAA AGTTGAAGTC CGAATTATTA GCCCCCCTTA 420
TTTATTAGCC CCGCTGTTTA CCCCCACCCC CCCATTTCTG TTCAACAAAG ACTTTCTCAA 480
CACATTTCTA AACATAATAG TTTTAATAAC TCATCTCTAT TAACTGATTT ATTTTATCTT 540
TGCCATGATG ACAGTAAATA ATATTTGACT AGATATTCAT CAAGACACTT CTATACAGCT 600
TAAAGTGACA TTTAAAGGCT TAAGGTTAAT TAGGTTAACT AGGCAGGTTA GAGTAATTAG 660
CAAGTTATTG TATAACGACG GTTTGTTCTG CAGACTATCA GAAAAAATTG CTTAAAAGGG 720
CTAATGATTT CGACGTTAAA ATTGTTTAAA AAAAAAAATT AATTGCTTTT TTTCTAGCTG 780
AAATTAAACA AATAAGACTT TCTCCAGAAG AAAAAAAAAT ATTATCAGAC ATCAGAGCTG 840
TGAAAATTCC CTTGCTCTGT TAAACATCAT TTGGAAAATA TTTAAAAATG AAAAAAAAAA 900
TCAAAGGGGG CTAATATTTC TGACTTCAAC TGTATACTGG CATAAAACAG TAGTTATTGT 960
TGAAAGTAAT CTTACAGTAT AATAGACCTA TATGAGACCT GTATTAAGTT TCTTTTGACC 1020
TAATTATGCA CCACATGGCA TTTTATTAAG TGGGACAGGC TCTATGTTTA CCTTGTTTCA 1080
TTGAGACTTC TTTTTTTGTT TTATTTCTAC ATATTTAGAA CATTACAAAA GAA 1133