EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR002-11496 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_24hpf 
Coordinate
chr13:49480779-49482282 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
HOXA10MA0899.1chr13:49481954-49481965GGTAATAAAAA+6.62
SOX10MA0442.2chr13:49481639-49481650TGCTTTGTTTT-6.02
YY1MA0095.2chr13:49481118-49481130CAAGATGGCGGC+7.22
Enhancer Sequence
GTCGTTCGTG GGATTCATTC ACAAACGAAT CGCTCCCTCC GTCAGGAGAG GAGGTGTGTT 60
TCAGGACACG GATTAGATTA AATTTAATAG TACATTTGAA TAGTACATTT GACAAGCTTT 120
TTTTGTCAGG AATGCACGTG CGGTCACTGA TCCGTCAATG TAGATAAGTG ATGTAAAATT 180
ATTATTTTCG TAATTAGAAA AAAAAAATAC ATACTAACAT CCAGGAAAAC TCCCGATCAC 240
AGATATATGT GTATATGTGT ATATCTCTGG CTTTGGATGG CCGCAGTCCT CCACTGTACC 300
TTGGTCCCGC ATTCATTTCA AAGGAGCGCT ACCCTGTGGC AAGATGGCGG CGCTATTGAC 360
GCATTCCTTC CAATAGACAA CAATAGGCCA GGCGACATCT AATGTGTATA TATGTATGTA 420
TGTATGTATG TGCTCCAATG AGGTGCGCTC TCTTCAGCGC TCACCATGAC AACGAGACTC 480
ACAGCAGTGA CGTCGCATTG TAAACATTTG AATATGCATT CCTATAAAGC CCGTCGCTTT 540
TCTTTCAGTG TCGTCAGTTC GCTCGGTGTT GCTGTTTGTA CTTGACCAAG GTGAGTTTAA 600
TACCTGACGG TATGAGTGGA GCTAATCTCA CCAAGTCCGC TTCGTGAAGC TTCACTCGGG 660
CCCGTCTGTG CTGTAGGACC CTCAGGGAAA CACGGGAGGC CGGTAGTGGG ACCCCGCTGC 720
GCGGGTTATG GTGGGTGGGA GCAGCGAGGC CCACTCATCG TCTATTTTAA AGTAGTTTCA 780
AGCTTTAGTT TACAATAGTT TAAAATAGAA ACCATGGTAA GTGTAATGTT TTAACTGTAT 840
GTCTGGCTGT TGTAATGTTT TGCTTTGTTT TTCAGCAGAG CTGTTGAGCA AAGAAGAATA 900
TTGAAGACAA CCGCGGGTTA TATTCATGAG CGCGCGCGAT ATAATGTTTC CCTGCTGTTT 960
TCTGAAAGTT TCTCTTGTTT GGATAAGTTT GCAGGTCAAA CAAAATAAAC TGTACTCTTT 1020
CTAAACACCT GTCCCGTGTT ATATTTGTCC TCTACAGCAA CACACTGTCA TTTAAGTCTG 1080
TTAAATGCAT ATTTGTATGC AACATGGTTT GACAATAAAG TAGTCTGACA AATAAATGGT 1140
TATAAATGTA CCTTCATTTG TCAGCATTTG GTGTAGGTAA TAAAAAGATA ATCAAAGATG 1200
TCCCAAGACA TGTAATGTTA ATATTCTGTA TGTTTAAAAC CAGCGGAATA TACTATATAA 1260
TTAACATGAA CTTACTGTTA CTCAAACATT CGCTTAATAA AAATGTCCTA CGGCAAGAAA 1320
GGGTTTTGTT TTGGTTTTAT GTCAAACTAC TGTAGGTTTT AGATTGACAA CAGCAGGTCT 1380
CTATATCATA ATAAGGGTAG TCAGAGTTAT TATAATGACC CAAATAAAGT AAAATGTCTC 1440
ATACGCGAGT ACTTTTAGCA TGCAAAAGTC AAATTTAAGT ATATAAAATA CATTTTCCAA 1500
CAA 1503