EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR002-11403 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_24hpf 
Coordinate
chr13:48234380-48236354 
TF binding sites/motifs
Number: 13             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOXB1MA0845.1chr13:48234817-48234828TTATTTACATA-6.02
MecomMA0029.1chr13:48234637-48234651GAGATAAGATAATG+6.42
RFX1MA0509.2chr13:48236145-48236161GGTTGTCATGGTGACA+6.25
RFX1MA0509.2chr13:48236145-48236161GGTTGTCATGGTGACA-6.25
RFX2MA0600.2chr13:48236145-48236161GGTTGTCATGGTGACA-6.01
RFX2MA0600.2chr13:48236145-48236161GGTTGTCATGGTGACA+6.09
RFX3MA0798.1chr13:48236145-48236161GGTTGTCATGGTGACA-6.18
RFX4MA0799.1chr13:48236145-48236161GGTTGTCATGGTGACA-6.16
Rhox11MA0629.1chr13:48235441-48235458ACATTTTACAGCGAATT-6.38
SOX21MA0866.1chr13:48235927-48235942AACACTGGAATTGCT-7.01
Sox11MA0869.1chr13:48235927-48235942AACACTGGAATTGCT-6.64
ZNF384MA1125.1chr13:48234978-48234990TTTTTTTTTTAT-6.27
ZNF384MA1125.1chr13:48234977-48234989TTTTTTTTTTTA-6.37
Enhancer Sequence
CAGGCCTGGA AAAGTTTTGG AAAAATAAAT AAACCCAAAA TGTTTTGGAA AAGTCTTGGA 60
AAATTGTTTA ACAAATATCT GTGTACTTGA ATATTGTGTA AATTTAAAAT AAAATTTTGT 120
TGTCTATCCC CTCACCTGAC ATTCTCTGTT TAGGGCAAAA AACAACTTGC AGTTTCAGCT 180
TCACCTCTCT TTCACCTGCA TTAATTGTAA TTCAAGATAC ATTTGAGTGT CATGTCCAGA 240
AACAATCTCT TACTACAGAG ATAAGATAAT GTGGGTGCTA AAGGCTAATT TGTGCTAATT 300
TAATAAGATA ATAACATTTC TCAATTTTCA CACAAGATAT TTTATAAAAC TACTTTACAG 360
GTATAAAATA CTCATAAACT ACATACATTG TCACATTCTT TTGATATGCT GTAATAAATT 420
TGAACATGCA TTTTGTATTA TTTACATAGA CATTACATGA AACATTAGGT CATCAATATT 480
TACCTGAAAG TTTTGGAAAA GTCCTAGAAT TTTAGTAGTA AAAATGTGCA TGAACCCTGT 540
TCCATGCAAA TTTGAACTCT GCTCTGTTTT CACCAAAATA ACGAAAGTCT TTGTAGGTTT 600
TTTTTTTTAT GTAGGATGTT AAAGTACTGT AAAAATACTC CAATATGTCT CTGCCAATGT 660
TTTCAAACAA TTATATTTGA TTTACCAAAG TCACACAAGT GCCAATTTCA CATCCGTCAC 720
ATCCATAACA AAGAGATATC ACATCAATAA ACAAGCTTTC CCATCATTAA TGCAAAAATG 780
TCAAATAAAT AAAACCAATC ATGTTTCAAG GTTTTTGCTG GGTCTTAAAA AGTCTTAAAT 840
TTCAAAACCT AAATTTTAGG CGTTAAAAAG TATTACATTT ACTGACATAT TGAGTTGTAG 900
ATCCTTAATT GTTTTAAACG GTTCTGAATT TATTTTCGTT CAAGTGAAGC TACTCAGTTT 960
GGGCCTATAT CAATCTAATG ACCAACAACA CATCTCAATA AAACCATATA TTTTTAGATT 1020
TAAGTTTTTT TATTGTTAAG AGATAGTTCA CAAGCTGTTA GACATTTTAC AGCGAATTCC 1080
CCAAATTAAA TTCCCTAATC AGGGGGAAAA AATAAAATCA TTTACATGAT TCCTTATGAT 1140
AATGCTGGGC CATTAGAAAA AAAATCTTAA CCCTAAATAA GCCTAAAATT TCATTCTTTG 1200
TGGTCTTAAA ATTGACTGAA TGAAACCTGC AGAAACCCTG TGTTTGTTCT CTCATGAGCT 1260
TTTGATGAGC ATCATTTCTT TACGGTTGTG CGGTTTAATT CACAGAATTT TCTACAAAGT 1320
ATATTGTATA ACATGTAAAC TCACTAACTT TTTGGTCACA TCCATAACGC CTGCTTATTT 1380
TCCTCATTTA AAATCGAAAT AAATGTTTAC AGATTGATAT TTCTGATCCC AGAACTCTGT 1440
GGTTAGTAGT TTTGGCACAC ATAAACAGAT GTTTCAATTT AATGTTATCA TATTCTTTCT 1500
CTGTGACTTT AAATCTTAAG TTTTTTTACT GCAAATGTCA CATCTGTAAC ACTGGAATTG 1560
CTCAGATGCT GTTTAATGCA TGACCCTCGG CAGTCTGCTC CTGTCTGACC TAGTTGAGCG 1620
GTTACAAAAA AAGCGCGGTG AAACCTCCGT CTGGTGTCAG TGAGTGATGT GAGAGTGATG 1680
CCGCTTGATG CTTTAACCGG ATGGACTTTC CCTGCGCTCG CTCAATCCAC TGTCTAATCC 1740
GCCCTCCTAA TTGAACTGAC AGCGCGGTTG TCATGGTGAC ACGGATTTGC GCGTGCTGTG 1800
ACTAGACGGC GGGGATTTGC TGATTCGCTC GACGCCATTG ACCTGCTTTC TGTCGTAATG 1860
CAGCGGCTGG AGCTCATCTG TGCTTTTTAC ATGAATATAT GTTTGTGCTG CTCGGCTTAA 1920
CGGCCGGCCA ACTGTTGGCC ATCAGTTATA GAGGATACTC TGAAACAATT GAAT 1974