EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR002-11054 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_24hpf 
Coordinate
chr13:39473120-39475574 
TF binding sites/motifs
Number: 23             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOXC2MA0846.1chr13:39473694-39473706ATTGTTTACTTT-6.44
FOXF2MA0030.1chr13:39473694-39473708ATTGTTTACTTTTG-6.63
Foxj3MA0851.1chr13:39473691-39473708CTCATTGTTTACTTTTG-6.44
HNF4GMA0484.1chr13:39473381-39473396AAAGTGCAAAGTGCA+6.15
IRF1MA0050.2chr13:39473697-39473718GTTTACTTTTGCTTTCACTCT+6.85
IRF2MA0051.1chr13:39473702-39473720CTTTTGCTTTCACTCTCG-6.02
JUN(var.2)MA0489.1chr13:39475486-39475500ATGAGTCATTTTTT-7.52
Lhx3MA0135.1chr13:39473764-39473777AAATAATTAATTT-6.78
NFYAMA0060.3chr13:39475531-39475542TCTGATTGGCT-6.32
NFYAMA0060.3chr13:39473524-39473535AACCAATCAGA+6.62
NFYBMA0502.1chr13:39473519-39473534GAATAAACCAATCAG+6.24
OLIG2MA0678.1chr13:39473924-39473934ACCATATGGT+6.02
OLIG2MA0678.1chr13:39473924-39473934ACCATATGGT-6.02
POU4F1MA0790.1chr13:39473762-39473776ATAAATAATTAATT+6.63
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ZNF384MA1125.1chr13:39475459-39475471TTTTTTTTTTTT-6.22
Enhancer Sequence
ATTACAGTAG CTTTGATTCT CGCCTTTCAT GTATACAAAA CACTCGTTTA CCTTAATTTT 60
GTTTGGTTTT TAAAAATTAT CTTTGAAGGT ACAGCATGTT TGGAAATGAC GTAGAATAAA 120
TGTATAAATT ACTTCAGTCT ATTTTCACCT GGGTGTCTCA CAACTGAGAA TAGAGCTTGC 180
ACCATATAAC GAAGCCTCTG TCACGTTTTA CGTTGCACTT TTTTGTTAAC ATTTAGGGCT 240
CTATTTTGAC GATCCATGCA CAAAGTGCAA AGTGCAGGGC GCAAACGCAT TTAGAATCCA 300
CTTTTGCTAT TATAACGACA GAAAAATGAG CTTTGCGCCA CAGTGCATGG TCTTACAGGG 360
TTGTGTTTAT TCTCTTAATG AGTTATAGGT GTGTTTTGAG AATAAACCAA TCAGAGTCTC 420
ATCTCCCATT TTCTTTAAGA GCCAGTTGCG CAGCGCCATA GCGCATTTGC TATTTACATG 480
GCAGACTTTG TAAGTGGAAA AACTGAGCGC TTCACTAGAG AGAAAACAGT TAAACAGAGC 540
ATCTACAGCA CGAGAATAAA ATTTAAGCCT CCTCATTGTT TACTTTTGCT TTCACTCTCG 600
TGGATAGAGA AACGTGTTGT ATGCACAGAT ATCCATTAGC CCATAAATAA TTAATTTTGT 660
TTGTTAAGCG CAAAGATTTG TTTCAAAACT TTTTCTAAAT TCAGTTCTTA TATCCAGCAA 720
ACGAATTAAT GAACAACAAT AACGAAGTGT GGTCAAAAAA CTTATATAAT AAATCCAATT 780
TCTATCCAAA TACACATGCT ATGCACCATA TGGTCTATAA CCTGACAGGT GGGCAAATCT 840
AAGCATGTTT TTAATAAAAC AAATATAAAT ATGCATATTA TAAATAATAG TGCTAATAAT 900
AATAACATTA TACAAAAGCA AATTGTTATG AATAAACTGA AAAAGCCCCC CGAGATGAAG 960
AAGGCATGAA GGTATGGTTT TTATATTTAT GCAGGTTAGA AAATAATAAT TTTTGTAATA 1020
TTTTAATCCT ATCTTTTTCA TTTGTAAAGT TATTTGTGTT TTGCTGTACA TCCTGTGTGT 1080
ATTAAGCAAT GTGTAAGCAA GGCGCACAAC TAACGTGCTC TGAGCTGGAC AACAGACCAG 1140
CTTTGATCTG ATCTATTAAA CCATCCATTT GCTATGGGCG CACATATGAG TGCAAGTGCA 1200
TTTGCCATTT AAACAGCGTG GTGCAAAACG TCAAAACGAC TCTTGCGGCG AGCTAAAACT 1260
AGCAAACAAT AATTGCGTCA TGCATTGCGC CGGGTGTATG ATAGAGCCCT TAATAATATT 1320
TATTTAGGAT ATGAGTTTTC ACATTCTGAT TCCAATGCCA ATACTGTTAA AATGACTATA 1380
ATTAAATGAA ATATTCTTAA GAATAACCTA TTATGTTTTC TTTGAGTGTA CTTGCATTAT 1440
GATGATATTA TATATGTCAT TCTGGCATTC AAGAGTTCAC ACTTAGATAT TGTTTGATGC 1500
TATAAGCAGG TTTGGCATGC TGTCCCGGGA GAGAACCCTG AGCTTGGAGA TAATTGAGCC 1560
CAGGGTAGAG ATCTGCAAGG GACTAAATTT TGAATCCCGC TCCTGCCCGC ACCCGCCAGG 1620
TTTTAGCCCG AACCCAACCG CTCCCGCTTA TATTCAGCAT TTGTTGTCCC GCTGCCCGAC 1680
CCGCCCCATT TTCTACCCGC TGCGCCTGTT CCCGCTAACG GACGGGGGGA GAACAAAACT 1740
GAAAACCACC CAGCTATACA GTGTCCAAAC AAGCTGTCTG TATAAACACA CACACACACA 1800
CACACACACA CACACACACA CAAGCACAAG CAAGTGACAC ACACACAGAC AGCGTCTCTT 1860
TCTCTCTCTC TTTCATTCAC AAAAACAAAC ACACACACAC ACACACACAC ACACACACAC 1920
ACACACACAC ACACACACAC ACACAGAGAG AGAGAGAGAG AGAGAGAGCA CAAAGCTCTT 1980
TCTCTCATTC GCACACACAT AGACAGCAAC AAACAAGCTA AACGCAGCAT CATGCTGTCT 2040
CATTCGCACA TACATACGCA TGCTCGTTCA CTCAGAAGTT GGAAGCGATA TTGTTAGACC 2100
ACCCGCTCCC GTCCAAAGTT AAACCCGTTA CCGACCGCTC CCGCGCTTTA TTCAGAAATT 2160
TATTCCCGCA CCACAGAAAT GTGGTCAGGT CCCACGGCTC CCGCGGGACA GCCGCAGGAA 2220
TGCAGACCTC CAGCCCAGGG CTCCCGCCTG ATCGATAGAG CATGTAAGGG GAGTACAAGC 2280
TCGGGTGGTT CTCGAAAGCT CCCCGAGGTA AAAGGGGAGA AGGGGTGGAT GTTTTTTTTT 2340
TTTTTTTTTT TGGAAAATGA AGATAAATGA GTCATTTTTT TTCTAGGCTA CTTATAGTAA 2400
GTTTGGATTA ATCTGATTGG CTAACTAATG ATTGTAGATG AGAGACCAGC TGCA 2454