EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR002-11033 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_24hpf 
Coordinate
chr13:39056172-39057001 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
HOXD10MA1506.1chr13:39056544-39056555GTTTTACGACT-6.02
HOXD12MA0873.1chr13:39056544-39056555GTTTTACGACT-6.32
RUNX1MA0002.2chr13:39056916-39056927GTCTGTGGTTT+6.62
Enhancer Sequence
TAGTGACCGG TGTTGTACCG GCTTGTGTGA GTGTGAGCGC CTCCCTTAAA CTCAGTCTTA 60
CAACACAGAG AAGACAAGTT TGGACAATAT TTACGATCTA CGACTCTCAC CGCTCACATT 120
ATGGAGATGT GATTTATTTT TTCATCAAGT CCGACCGACC TGGAGTTTTA CCTCTGCTTG 180
AAAGACAGGG CTTGGGCGGA TTTTCAACGG CATGCGGAGG AATTAGGCAG CCGGGTGATC 240
AGAGCGTCGT GGCGGCATTG CTCTGAAATC CAGCCCGTGG TTTGAGGCCT ATATTCCCGA 300
AGCGGATACA TGTACGTTGT TTTTATGTAC CCAAAAGCTA TATATTTCAT CAACCGATAT 360
CTGTTTTGTA GCGTTTTACG ACTTGTGATA GGTAACGTTA GCATATCTGT TAAGCTACGC 420
AAATAGTGTT ATGTTTGTGA CGGCGGGTCA TTTGACAAGC AAAACAGGCT AACGTTAACG 480
CTGGAGCAAA CAGGACGCGA TTCAAACACA ATATACATGA ATTAGAAACG ATAAGCTAAT 540
AATAAGAAAC TAAATCTTTT CAACATATAC TAGTCTATGC TGTTAAGTAA CGTTGATCGT 600
GCAGTAATGT AATCTTCAGA AAATAAGGCT GCGATGATGT TTGTAGTTGA ATTATCAAAC 660
GTTAATCAGG TGCTTATGTG CATGTTTGTT TTAGAGAACT TTTATTTTAC ATGATAGTGA 720
AAGTTGGGTT CATATCTTTT TACAGTCTGT GGTTTATATT TGATTTAACG GTTTATGTGT 780
ACACATGTCT TTTTTTACAT AGGATTGTGT TGATCAGTTG ACATGAGGA 829