EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR002-09396 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_24hpf 
Coordinate
chr13:8248973-8249620 
TF binding sites/motifs
Number: 9             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
GATA6MA1104.1chr13:8249020-8249033TATCTTATCTTTT-6.54
IKZF1MA1508.1chr13:8249413-8249425AAAACAGGAAGC+6.62
Lhx3MA0135.1chr13:8249138-8249151AAATAATTAATTC-6.22
MecomMA0029.1chr13:8249017-8249031ACTTATCTTATCTT-6.87
PBX2MA1113.1chr13:8248989-8249001GTGATTGACAGG+7.22
PBX3MA1114.1chr13:8248987-8249004GCGTGATTGACAGGTGG+6.4
POU4F1MA0790.1chr13:8249136-8249150ATAAATAATTAATT+6.63
POU4F3MA0791.1chr13:8249133-8249149TTCATAAATAATTAAT-6.12
POU4F3MA0791.1chr13:8249136-8249152ATAAATAATTAATTCA+6.28
Enhancer Sequence
GAGTCCTGCA GAAAGCGTGA TTGACAGGTG GTAATTTGTG TGTAACTTAT CTTATCTTTT 60
TTTATTCATG ATTTGTTTAT GGGTAAAACC AAGACCATGC GGGTCAGGTA GTTGAAACAG 120
TAGGCTACAA ATAATTCATT CATAATGAAT TAATTCATTA TTCATAAATA ATTAATTCAC 180
CGCTGCCTAT GATAACAATG CCATCATCCA TCTCGATGTT TCACATTAGA CATCATACAA 240
TGCCAAATTG GTCGACATCG CCCGACCCTA GTGAAAACAG CCAAATTGCT TATCACTGGC 300
TGATTTTTGG GAATCAAAAT CAGTAAGTGA GCACACAGTA TGTACCTTGA AATTACCGAA 360
GGCTTCAGGT CCCCAAGCCT CACCCCGCCA CCTCCTCTCT GTCCCCCTCT ATCTCTCTGG 420
GAAGTAAACG TGGGAGAGTG AAAACAGGAA GCCCAGGCTA CCGTGTGACT CAAACGCACC 480
GCTGGTATTT TTAGCTGTGG CCCGGCAGTA CCCCGGCCCT TGTTTCCTCC GGGGCCACCG 540
GGAGGATACT ACTGTCCGCT CCTCTGTCGG ACCCCATAGG GAAATGAGGT CAAGCTAAGA 600
AAGGGTCCTG TCAAGCCAGA CAGCCTTTAT ATTGGTCCTG TCTGTCA 647