EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR002-08904 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_24hpf 
Coordinate
chr13:596394-598662 
TF binding sites/motifs
Number: 28             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
BHLHE41MA0636.1chr13:598353-598363GTCACGTGAC+6.02
BHLHE41MA0636.1chr13:598353-598363GTCACGTGAC-6.02
FOXD2MA0847.2chr13:597818-597831ATGTTTATTTAGC-6
FOXE1MA1487.1chr13:597817-597832AATGTTTATTTAGCA-6.24
FOXF2MA0030.1chr13:597547-597561AATGTTTACGTTTG-6.67
FOXK1MA0852.2chr13:597805-597819CATGTAAACAAGAA+6.24
FOXK2MA1103.1chr13:597806-597817ATGTAAACAAG+6.62
Foxd3MA0041.1chr13:597816-597828GAATGTTTATTT+6.74
Foxo1MA0480.1chr13:597807-597818TGTAAACAAGA-6.02
IKZF1MA1508.1chr13:598635-598647CAAACAGGAAGT+6.02
KLF13MA0657.1chr13:598040-598058GGAAAATGGGCGTGGCTT-6.69
KLF14MA0740.1chr13:598043-598057AAATGGGCGTGGCT-6.42
Klf12MA0742.1chr13:598042-598057AAAATGGGCGTGGCT-6.22
MITFMA0620.2chr13:598349-598367GTAGGTCACGTGACCTTG+8.57
MITFMA0620.2chr13:598349-598367GTAGGTCACGTGACCTTG-8.57
PHOX2AMA0713.1chr13:597651-597662TAATTGAATTA-6.14
POU3F3MA0788.1chr13:597925-597938AAATTAACATAAT-6.64
Phox2bMA0681.1chr13:597651-597662TAATTGAATTA-6.14
SP1MA0079.4chr13:598585-598600TTAGCCACGCCCAAT+6.1
SP1MA0079.4chr13:598044-598059AATGGGCGTGGCTTG-6.95
SP4MA0685.1chr13:598585-598602TTAGCCACGCCCAATAC+6.11
SP4MA0685.1chr13:598042-598059AAAATGGGCGTGGCTTG-7.82
USF1MA0093.2chr13:598353-598364GTCACGTGACC+6.14
USF1MA0093.2chr13:598352-598363GGTCACGTGAC-6.14
USF2MA0526.2chr13:598351-598367AGGTCACGTGACCTTG-6.91
USF2MA0526.2chr13:598349-598365GTAGGTCACGTGACCT+6.96
YY1MA0095.2chr13:598368-598380CAAAATGGCGGA+6.11
YY2MA0748.1chr13:598370-598381AAATGGCGGAC-6.14
Enhancer Sequence
GATCAGTGAA GTGATCCTGA GCTCATTACA GCAGAAATGA TCATTCACTG CAGTTCAGTG 60
TACACATATC AAACTGGTAC AGGGATATAT ATATATATAT ATATATATAT ATATATATAT 120
ATATATATAT ATATATATAT ATATATATAT ATATATATAT ATATATATAT ATATATATAT 180
ATATTACATA TACTGTATGA CATACAAGTT CATATTTAGA TTTTTCATAT ATAAGAGAGA 240
GGTCATATAT GCAACATATA CACTCACCGG CCACTTTATT AGGTACACCT TACTACTACC 300
GGGTTGGACC CCCTCAGAAC TGCTTTCATC CTTCATGGCA GAGATTCAAC AAGCTGCTGG 360
AAATATTCCT CAGAGATTTT GCTCCATATT GTCATGATAG CGTCACACAG TTGCTGCAGA 420
TTTGTCGGCT GCACATCCAT GATGCCAATC TCCCGTTCCA CCACATCCCA AAGCTGCTCT 480
ATTGGATTGA GTTCTGGTGA CTGTGGAGGC CATTTGAGTA CAGTGAACTC ATCGTCATGT 540
TCAAGAAACC AGTCTGAGAT GATTGAGCTT TATGACATGC TGCGTTATCC TGCTGGAAGT 600
AGCCATCAGA AGATGGAGAC ACTGTGCTCA TAAAGGGATG GACATGGTCA GCAGCAATAC 660
TCAGGTAGGC TGTGGCGTTG ATGCTCAATT GGTACTAATG GACCCAAAGA AAATCTCCCC 720
CACACCATTA CACCACCACC ACCAGCCTGA ACCGCTGATA CAAGGCAGGA TGATCCATGC 780
TTTCATGTTG TTGAGGCCAA ATTCTGACCC GATTATTTTC TGTAAACCCT AGAGATGGTT 840
GTGCGTGAAA ATCCCAGTAG CTCAGCAGTT TCTGAAATAC TCAGAGCAGC CCGTCTGGTA 900
GCAACAACCA TGCCACGTTC AAAGTCTCTT AAATCCCCTT TCTTCCCCAT TCTGATGCTC 960
GCTTTGAACT GCAGAAGATC GCTTTGACCA TGTCTACATG CCAAAATGCA TCGAGCTGCT 1020
GCCATGTGAT TAACTGATTG GAAATTTGTG TTATCAAACA GTCTGACAGG TGTACCTAAT 1080
AAAATGGCCG GTGACTATCT GACACACACA TATACATGTT ATTGCGTGTT GTTACAATGT 1140
AACCTGCTCA GCTAATGTTT ACGTTTGTAA TATTTAGATT ACTTGCTAAA TAAAAACCAT 1200
CTCATGTGGA TTTTAATAAC TGAGTCATTG CTGCTGTCCT CCGGAGGTCT CAAGCCTTAA 1260
TTGAATTACA CTGTTTTCCA CCATCTGGCA ACCCCGAGTG CTGATATATT GGGTAAAATG 1320
GCAGTGGGCT GGTTATAGAA ATCAAAACAA AGATGTCCCT ACACTGAACA CACATGTTCA 1380
AAGCAGAATA TATGACTTTA GCATTGTTTT TCATGTAAAC AAGAATGTTT ATTTAGCATG 1440
TTTCTGACGT ATCTGCAAAC ATATTATGGT ATTTCTGTGC TTTAGAAGAG CTTACATACA 1500
GCACTTATGT GAATAACAAT GTAATGTCGC AAAATTAACA TAATAAATTT AGATTTGACA 1560
TTTACTTTAA AGTCTGCATG AACTGGAAAT TGCGGCCATT TTTTTCATCG TGAGACAGTT 1620
CCTAGTAAAA CGGAAATTTA AATGAGGGAA AATGGGCGTG GCTTGTTTTT CTACTGTGTG 1680
CTGATTGGAT GTAGTAAAGT AGGCGTGTCA TTCAGAAAGA TCTGGGCTGC ATCCAAAACC 1740
GCATACTTCC ATACTATATG GTACGCTAAA ATCAGTATGC GAGCTGAGTA GTATGTCCGA 1800
ATTCATAGAA ATGGAAGATC AGTATGCGAG AAGTACCCGA ATGACTTACT ACGTCCGGCG 1860
AGATGCTGAA GTGCGCATAA CATGCACGCT GTGCTATCCC ATGATGCCCC GCTAGAGAAT 1920
TTGTAAATGG GAGTGAGGCG ACGAAACTTA CGCAGGTAGG TCACGTGACC TTGACAAAAT 1980
GGCGGACGTA GTACGTTCGA ATTCCATTCA TACTGCTCAC ATTCATACTG TATAGAACTA 2040
CGGGCGAGTA GTACGTTTAA ATTCAAATGC ATTACCTACT GAGTAGTAGG CGGTTTTGGA 2100
CGCAGCCCTG GTGGGGGGAA TTATAACAAT TTAACAGACT CCTCCTCCTC TCCATTTCTG 2160
TGTTGACAGT TGGAGGGGCG TGGTTGTGAT GTTAGCCACG CCCAATACCT CAGACAGACA 2220
ATCTGAGAAT TGAACTGAAA ACAAACAGGA AGTGCAGTTT CAGATTAC 2268