EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR002-08885 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_24hpf 
Coordinate
chr13:314501-315509 
TF binding sites/motifs
Number: 26             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOXA1MA0148.4chr13:314620-314636ACTAATGTAAACAAAT+6.04
FOXC2MA0846.1chr13:314623-314635AATGTAAACAAA+6.37
FOXD2MA0847.2chr13:314621-314634CTAATGTAAACAA+6.11
FOXK2MA1103.1chr13:314624-314635ATGTAAACAAA+6.32
FOXP2MA0593.1chr13:314624-314635ATGTAAACAAA+6.14
Foxj3MA0851.1chr13:314621-314638CTAATGTAAACAAATGA+6.14
RFX1MA0509.2chr13:314543-314559AGTTGCTATGGTAACA+6.54
RFX1MA0509.2chr13:314597-314613AGTTGCTATGGTAACA+6.54
RFX1MA0509.2chr13:314543-314559AGTTGCTATGGTAACA-6.55
RFX1MA0509.2chr13:314597-314613AGTTGCTATGGTAACA-6.55
RFX2MA0600.2chr13:314543-314559AGTTGCTATGGTAACA-6.82
RFX2MA0600.2chr13:314597-314613AGTTGCTATGGTAACA-6.82
RFX2MA0600.2chr13:314543-314559AGTTGCTATGGTAACA+6.86
RFX2MA0600.2chr13:314597-314613AGTTGCTATGGTAACA+6.86
RFX3MA0798.1chr13:314543-314559AGTTGCTATGGTAACA-6.48
RFX3MA0798.1chr13:314597-314613AGTTGCTATGGTAACA-6.48
RFX3MA0798.1chr13:314543-314559AGTTGCTATGGTAACA+6.73
RFX3MA0798.1chr13:314597-314613AGTTGCTATGGTAACA+6.73
RFX4MA0799.1chr13:314543-314559AGTTGCTATGGTAACA-6.28
RFX4MA0799.1chr13:314597-314613AGTTGCTATGGTAACA-6.28
RFX4MA0799.1chr13:314543-314559AGTTGCTATGGTAACA+6.69
RFX4MA0799.1chr13:314597-314613AGTTGCTATGGTAACA+6.69
RFX5MA0510.2chr13:314543-314559AGTTGCTATGGTAACA-7.13
RFX5MA0510.2chr13:314597-314613AGTTGCTATGGTAACA-7.13
RFX5MA0510.2chr13:314543-314559AGTTGCTATGGTAACA+7.14
RFX5MA0510.2chr13:314597-314613AGTTGCTATGGTAACA+7.14
Enhancer Sequence
AACACAACAA CTACAGTAGT TGATCTGTTG TGGTGATTCT ACAGTTGCTA TGGTAACACA 60
ACAACTACAG TAATTGATCT GTTGTGGTGA TTCTACAGTT GCTATGGTAA CACAACTGAA 120
CTAATGTAAA CAAATGACTC TGTACTGTAG TTTTCTACAG CTATAGGGTA TATTACATTA 180
CAGTACACCA CAGTTTACTG TAGTAAAAAC CAAAGTATAC AACAGTGTTT ATTACAGTCG 240
ATCACTTCAC TATAGTCAAC ACTACAGTAT GCTGGAGCGT TCATTAACAA CGACCTGCAG 300
ATATATTCAA TATAATACAC TTTACAATTA CTACAGTATT AACTTTAAAC CGTGTTGGGT 360
AAACAATGTA ATACGTACTA AAAGTATATT ATTACTTTAT TATTAATACA AATATATATC 420
AAAAGTAATA TATTACAATC TTCTAATAAA TCTTATTTTT TTTAAAATAG CATTACACTT 480
ACTGTAAGCT AGTTTACTTT CCTTTAAAGG AACACATTTA GCTACTTTAA AAGGTGATTT 540
TAGATTATAA TACATCACTT TTGTCCCAAC ACTGATGATG AATTATATCT GTCTTTCTTT 600
TGTGCATGAC AAAATCAGAT ATTGTAATAA ATGTTGTTTG TATCCTGAAA ATGAACGTCA 660
GTTTTACTCA GGGTCAAAAT GTACCACACA TTCAAGACAA TGAAACAGTC ATTAAACTAA 720
ACTAAACAGC TTTTAAACGA AATGACAGAA GCTTTAAAAG CAGCTGTAAT AGATCATGCA 780
GATGAGCAAG CTTTCTGACC GTTTCTCTTT CTAATCTACT CAAAACACAC TCAAAGCTCA 840
TCAATCCGAC TTTACTGAAG GTTATTATTC TAAATGACGA TACCTGCTGT GCTGAAGATC 900
TGCTGCGGTG TGTGTGGAGG AGCTGCTGAT CTGATGAAGC TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG 960
TGTGTGTGTT CGGGAATGTG AGCAGGTTGT TTCTCGCTGC TGGAGGAA 1008