EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR002-08817 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_24hpf 
Coordinate
chr12:48428849-48429962 
TF binding sites/motifs
Number: 12             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Arid3bMA0601.1chr12:48429677-48429688ATATTAATTAG+6.02
CremMA0609.1chr12:48429778-48429788TTACGTCATA-6.02
IRF4MA1419.1chr12:48429027-48429042CTGTTTCGGTTTCGT-6.82
IRF5MA1420.1chr12:48429028-48429042TGTTTCGGTTTCGT-6.34
IRF7MA0772.1chr12:48429028-48429042TGTTTCGGTTTCGT-6.13
IRF8MA0652.1chr12:48429028-48429042TGTTTCGGTTTCGT-6.89
IRF9MA0653.1chr12:48429028-48429043TGTTTCGGTTTCGTC-6.45
Lhx3MA0135.1chr12:48429261-48429274GTATAATTAATTT-6.19
MAFKMA0496.2chr12:48429569-48429588GACTACTGAGTCAGCAATA-6.28
MAFKMA0496.2chr12:48429569-48429588GACTACTGAGTCAGCAATA+6.62
NFYAMA0060.3chr12:48429846-48429857AGCCAATCAGA+6.32
NFYBMA0502.1chr12:48429872-48429887CGCTGGACCAATCAG+6.06
Enhancer Sequence
ATTATCCCTT TAAAGATTGC CTCAGCAGCT CATTTGGACT AAGCCAAACG TCAATCTCTT 60
ACATCAACTA TACCACCATA GACGTTTAAA AACAAATACT AGTACATAAC ATATGTGTAA 120
CTTACGTTTA TAATAATAAA TACGTTCACA ATTAACAAAC CTTTCGCTGT GAATCGACCT 180
GTTTCGGTTT CGTCGATGTT CCGTTCGTTG AGGATCCTGA TAACACTACG CGAGTTCCAC 240
GTCACGTTTC AAGCGTTTAT GTCCCGCCAT GAAAAAATAA ACGTCAATAA AGCCGTACAA 300
CGAGAGCAGA TAGGAGTGAA ATACACCTTA ATAGTTCCTT ATTCCAATTG AGAGTCAATT 360
TAAAGCATTC CCCTTACATT TTCTTTAAAC TGTGTAAGGC TACATGAGGA ATGTATAATT 420
AATTTACAGT CAATTATGAA TAACAGTATC AACAAAACTA ACCTTTCATC CAACTCTCGA 480
ATTTTTTCTA ATTTAGCCTT ATTGATAATA TTTGAGTGTA TTATTTGAAC TAATATGCAC 540
ATATAGCACC ATAATATATG AGAATCCTGC TTTGAAATAC AGTTAATTCA TTAAACAACA 600
TGTTTTTCTG CTGTTATAGT CTTCATAACA GCGGCTTACA TGTCCCAAAT CAGCCTCATG 660
TTTGTACTTG TCTCCTATTC TCATGTAAAG GCATCTGTGT TCACGTTCAC ATTACTTCCA 720
GACTACTGAG TCAGCAATAA CTCCTGTATA ATTCAGATTA ATACATTTAA ACAGGCTTTC 780
ACTCGTGTAA TATAAGTCTA CAAGACCGCG ATTATAATAT GAAAGGGCAT ATTAATTAGC 840
TTAATCACCG AATATATATT GGGAGGTTTT GGCGTGTTAC TACTGACACA GTAACCCGGG 900
GCTCGGTGTT ATTCCCGGTC ACTGCGGCGT TACGTCATAA CGGCGCGGGT TACAGCAGTT 960
CACAACCACC CGGGATATTC AACAGCAGAT CAGCGCGAGC CAATCAGAAG CCCCGTATGA 1020
CCGCGCTGGA CCAATCAGCG CGCGGCTCTC CGGTGAACTG ATGAAATTAG ACACCATCAA 1080
AACTCAACAA CACACTCATT TAGCATGCAT ACT 1113