EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR002-08071 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_24hpf 
Coordinate
chr12:30972527-30974602 
TF binding sites/motifs
Number: 11             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOXE1MA1487.1chr12:30973547-30973562CAATAAACAAACAAT+6.18
Foxd3MA0041.1chr12:30973551-30973563AAACAAACAATT-6.22
NEUROD1MA1109.1chr12:30972815-30972828AGACAGATGGCAA+6.42
NFYBMA0502.1chr12:30973734-30973749CTGATTGGTGCATGT-6.56
POU1F1MA0784.1chr12:30973033-30973047AATATGCTAATCAG+6.64
POU6F2MA0793.1chr12:30974287-30974297ATAATGAGCT-6.02
RARAMA0729.1chr12:30973994-30974012AAGGGCAAAGGGTCATGG+6.31
RarbMA0857.1chr12:30973993-30974009AAAGGGCAAAGGGTCA+6.73
RargMA0859.1chr12:30973994-30974010AAGGGCAAAGGGTCAT+6.26
Rhox11MA0629.1chr12:30974166-30974183ACGCTGCTGTAAAGTGA+6.15
ZNF24MA1124.1chr12:30973322-30973335CATTCATTCTTTC+6.15
Enhancer Sequence
TCCCTTTGAC ACACTGCCTG CACACAGGGA TCACTAAGAC TTTGGGTGTC TGCTCTACCC 60
AACTAAATTG AAGTTAAATG AGCCAGGGGT TTGACACACA TGTGCACATC CATGTAAAGA 120
GCTTGGCACT TCTGTAGCGC TCTGTTGCGC ATACTATCTT TAGTGTTGAA CTGAGGTCCT 180
CGACTGCCCC TCCTCCTTGT TTTAGTGAGT GTACCACTCA GCCCTGTGCC TTCCACCACC 240
CTCCCCACAG GGTCACACTT TTAATTACAC AGAAACAGTA ATCCCATCAG ACAGATGGCA 300
AACAGGCCTT CACCCAATGA CTTTATGCCC AATTGAATCA TTACTGATGT TATTTGCTAA 360
ATTATAGCAA AACACAAAAA CACTGCCGAG TGGGATTTTC ACAAGAAGCT AGGAAAAGCA 420
GATGTGCCCT CCTGTCGAGC ATCTGTGACA GAGATCAAGA AGGCGTGAAG ACGGGAAGTG 480
GAACGCTGGG TCTGTTTTAA ATGAATAATA TGCTAATCAG TGCAAGCAAA TGCAGACCCC 540
TTATTATTCC TTGCGGTAAA AACAAACAAA AAAATTCCTT TATCGGACAA GACATTTCCA 600
ACCAACTTGG TTTGGTAAAC CACATAACAA GCGCAATTGA GAAGTGACGA GAGTTCCTTT 660
CTTAAAAGAG AGAGCATGTT TGGTTTATGG GCTTTGCTCA GCACCGCCGT TTGTCTTTGG 720
GGAACATCCC AAGAATCCAC TCTTTCCTGA AAACCAAACA CTGAGCTTCA ATCCACAACC 780
TTTGCTGCCA GAGCCCATTC ATTCTTTCTC TCACTTGCTC GCTCACTCAC TCACTCTTTC 840
TGTCTGTCTC TCTCTCTCAT CTTTTCCTCT GCCCATGGCT TCTGTCAACA ATTAGCGGTC 900
GCTTCTTCCA GAGTCCCAGA CCACAGCACC CCGAGCGTTA AACTATGCAA TCTCCCAATC 960
AGTCCCTCAA CATAAATTAC AGCTTGCAAC ATCATTTGGG AAAGAGATGC ACCCCAGTGC 1020
CAATAAACAA ACAATTCCCA TAAAATTGTT TTTGACAGAA TTAATACAAA CTCCAAACTA 1080
AGCCAGAGTC TTGACTATTC ATGCCATGAG CTCTAATAAA GTCAATAAAA ATATTTGGAG 1140
CCTATAATCT TGGCTTGCAG CAGAGCCTGA TTGCTCACCT GTCGTGTTGC TTGGTGTTAA 1200
TGTATGTCTG ATTGGTGCAT GTTCTGGCTG GGCCCCAGGG TGTCATATTC CATGCTGGGT 1260
GGCTAGACTT CGTGCCACAG TTGGGAGCAG CTCCTCGGTC CAACAGTGGT GCAGTAAATC 1320
TACATCTAAG CATTTGGGAC AAGCCACACA CCATAGAATA ACACTAACGT TTTCCATTTC 1380
ATAAAACATG TCTAGGTGAA AGCAGAATTA CGTCTTTGTG CTCCCAGATT GGTATTTTAA 1440
TTATTGTTTC TAAGCTACTA TAAAGCAAAG GGCAAAGGGT CATGGCTTAA GACAACAACT 1500
CGGTCACCAA ATCCAATTAT TTTGAGCTCA GCTCAAATTA GTTCATATAG AGTAGCTGTT 1560
TAAAATACTT GTCCCCTGCT TGGCCCTGAT AAGACTGGCA GCTTCCCTAC AACTGTAGCA 1620
GTTGGGTCTT AAGGCATGAA CGCTGCTGTA AAGTGATCCA AGAAGCGCTC TGAAAACTTT 1680
CAAGCTGTTT TTTTCATGCT TTCCTGACTT TGGGTCAATA GGCCGCTGCC TGCAGTTGTT 1740
CTTGTATGAA GAAGTGGGAG ATAATGAGCT GGAGAAGGAC CTTTAGAGAG CCACAAAAGA 1800
AAACAACCAG TATGCCTAAA AACAGGGGAT TCCTGGGACA TACAAAAAGA TTAATCATAA 1860
CTTCAAGTCA GAAGATGGCA GTTGGGAGGA AGTCAGAAAT TACTAACATA GATGCTACTG 1920
AAATGAGAGG TTTTTGAAAA TAGCCACAGA GCTTCAGGGA ACAGCAGTCA TGCCCGCCAA 1980
AGTGTCTCTG GTTCTCCGTT CTGTAATAAG ACAGCAGAAA TTTGCAACCA AATGACTGTC 2040
AACATAAAAT TTGCACACAC TTAAGTATCA TCAGT 2075