EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR002-07134 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_24hpf 
Coordinate
chr12:7944949-7945951 
TF binding sites/motifs
Number: 5             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
HMBOX1MA0895.1chr12:7945464-7945474GTTAACTAGT-6.02
Nr2f6(var.2)MA0728.1chr12:7945493-7945508TGACCTTTTGTCCTG-6.32
RARAMA0729.1chr12:7945490-7945508AAATGACCTTTTGTCCTG-6.48
RarbMA0857.1chr12:7945493-7945509TGACCTTTTGTCCTGA-6.38
RargMA0859.1chr12:7945492-7945508ATGACCTTTTGTCCTG-6.37
Enhancer Sequence
ATTGCTTTTG AAAACACTGC CAATTGGTTT TAGGCATGGT GGATGGATGG TCATTCGATC 60
AGTCGATCAG TCAGTCAGTG GACAGAGGCC TCTGGTGGAT TTAAGAGAGA ACAGCAGGCA 120
CGAAAGGCAT TCGCGAGAGA AATTTGAGAT TTTAAAAAGC ATACACAGCA CACTCTGGTG 180
GATTCGCAAA AAAACATAGC TCCTGCGACA TAATTGGCAC TCTCCAGAAA GGTATATAGG 240
GGTACATATT AAGAATGAGC CTGTGTTGAA ATTAATAATA GGATTAACTA AATTTTTTTA 300
GGGTAAATGA TTGCAAACAT TTTAAATAGG CTGGATTTAA ACAAACACAT TGAATGGAAT 360
ATAAATTTTA ATATCATAAT TTAATTCAGC CCAAATAAAC TGTTAGCACC TACTAACCTT 420
AAAAATTTTA GTACATCTAA TGAATCATTT GTTTGTGTAA ATAAGGGCTT AGGGTGAACA 480
GAAGAAGTTT GAAGGATCGC TTTGGACAAG GACGGGTTAA CTAGTCATCG TAAGACATTT 540
TAAATGACCT TTTGTCCTGA TTTTCGCTGT GCTGCTGGAA CTAGGTCTCT CCACCGACAG 600
CATGACGTAA AGGTCGGTCA GCCGGTCAGC TGGAGTTGTC CGTACCTAAG ACAGATCATG 660
GCATCGAGGG CTAGTCTCTC TTTTCACCAC AGTCGCTAAA AGAGGGTCTC ATTCATGATC 720
TGTGTATCAT CTTCAGCTGC GTCAGTCAAA ATGAGCCAGC AGTACAGTGA GATAGGGCCA 780
GCGTTTGTTA CGTCTGCATC ATCTACGCAT CACTGGCTCG TTTGTTTATC TCCAGAAGAA 840
GCCTTCAGAA TAGACAGCTT GAATGTGATG CATTCAGATC TTCACGCTGG GCATGTAATG 900
AGTGCATCCC ATGGGCTTTT GCTGCTGCGA AAGGCAATGA AAGAAATGAC CAAGTAAAAT 960
TTATTTTAAA AATTATTTTA TGTTTTAAAG TCAAAAGTGT GA 1002