EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR002-07040 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_24hpf 
Coordinate
chr12:5013321-5014482 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
BHLHE23MA0817.1chr12:5013443-5013455TAGCATATGTTT-6.32
PHOX2AMA0713.1chr12:5014423-5014434TAATTCAATTA+6.14
Phox2bMA0681.1chr12:5014423-5014434TAATTCAATTA+6.14
Enhancer Sequence
ATTCAGCAGC GGCCGCGCGC TCAGAGCGGA TAAACATTCA GAAAGCGGCA GCGTTTTCCG 60
TTTAAAGCAT TAATATTACT ATTAATCGAT GTTATGTTTA AAGTATGTCA TTTGTATATC 120
TGTAGCATAT GTTTAACGAG TGGGGTAAAG TTGGTTTTAT ATTCGCACAT TCGGGTTTTT 180
CTCCGTAATA ATGTCATTTC ATTAAAGTAA CGTTATTCTC TGCAAATTAA ACATGGGCAA 240
ATCATAATAG CAGCCAACGA CTATCAAACT ACAACATTCT ACAGTCAATC AAATTGTGCT 300
AATGTTGTTT TAAAGTTATA CTTGCATGCG GTTTCAGACC GAATATTCAA AGTAACAATA 360
GCGTGGTAAC TTCCATGAAG ATAAGTTCGA CAGATAAGTT ACTTTATTCA TCGCAAAGAG 420
AATTTTATAA ATAAGTTACC AACAGTGATC GATAAAAACA CTGACATAAT AAATACACAC 480
ATACTCGGAA AATATGAAGA GTTCAAATGC AAAAAAAAAC TCCAGGTGGC GGTTGTAATT 540
TTTGTCTAAA GATTAATGTA AAGTTGGTTT AATATTTGCA CATTTGTTCT ATTAACTCTT 600
TCTTTATTGT TTACCAGACC AGTTTGAATA TTCGGCCAGA ATTTAGCATG CAAGTATGTC 660
TTTAAAACAA CATTAGCACT ATCTAATAAA CTGTCAACAA TGTTGTACTT TGAAAATCAT 720
AATATAACAT ATTTTCCCTT GCAAAAGAAT ACTAATCTGA AATTATATTA TAAAGGAAAA 780
AGTCTGAATC TGTCTTTAAA GACTGATATA AAACCAACTT TACCTCTATC TTCTAAAGTG 840
AGCATTTTTC TCACCCTAAT GTGTTAATTC CGTAACCTCA CTTAAAAAGA ACTATTTTAT 900
TTTGCATAAA AGTGATATTA ATGAACACAA AGGAAGCTAA AAAAATATAT TTTAGAAGAT 960
AATTTTTGAT GGCACTTTGA GGCTTTTGCC ATAGAGCTCT TCATATACAT GCATATTCAC 1020
ACATCTTAGT ATGTTCAATT TAAGTATATT TACAATAATT ATTGTTTCAA AGCAGCTTTT 1080
TGAAAGGTGC ACATTATAGC ATTAATTCAA TTAAAAGTTA AATAAAAAGT TAAAGCTACA 1140
ATCAAATTTA AGTTATTATA T 1161