EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR002-06471 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_24hpf 
Coordinate
chr11:40517507-40518437 
TF binding sites/motifs
Number: 6             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
EsrrgMA0643.1chr11:40518140-40518150ATGACCTTGA-6.02
NR2F1MA0017.2chr11:40517821-40517834CTCTTGACCCCTG-6.04
Nr2f6(var.2)MA0728.1chr11:40517817-40517832TGACCTCTTGACCCC-8.07
RORAMA0071.1chr11:40518141-40518151TGACCTTGAT-6.02
RarbMA0857.1chr11:40517817-40517833TGACCTCTTGACCCCT-7.54
RargMA0859.1chr11:40517816-40517832GTGACCTCTTGACCCC-7.53
Enhancer Sequence
AGAGGAAACC CACGCTAGGA CTCAAACCAG CGACCTTCTT GCTGTGAGAC GACAGTGCTA 60
ACCACTAAGC CACCATGCTG CCTCTAAACA AACATGTAAA AGCTACAATT ACAGCATGTA 120
AATCACAACT GCACCGCAAG CACATGCAGC AGACTTGCCT TTGCTACTCA GCAGGAATGT 180
CGTCCACAAA ATGCTGTACT CTTAACACGT TCTCATACAT GTAACACACA CACAGTCACA 240
CTCTGCTGTA CACACACACA CACACATAGA GCACATCCCC GTGGAAGAAT GCTAAGAGGT 300
TTCAGGAATG TGACCTCTTG ACCCCTGAAG CCTGCCTGGA GACGTCCACA CTGAGGCCGG 360
ACAGTATGGA GGCCAGACGG GTAATAGTAA ATGGCCAGGA AACTTTCAGT AATAGTTATA 420
CAACACACTG TTACCCTTTC GAAGAGTGAC ACAGATTCTA GTTTTAGGTT GCAGGAAGGG 480
TACGTCGTGT TCATCTCTCA TCAGATGCTT GCAGTCGTAC ATTTTTTTTC TTGCGTTCAT 540
TAATCCTGAC TTTCCAGTTT GACCGTTTTT TTTCCCTCTG TCTCTCTTTC TGTCTATCTC 600
TCTCTCTCTC CTTTGGCTAC ACATGTTGAG CTCATGACCT TGATTCTTGA CAAATGGAGA 660
GAAACGATCA GGATAAGAAA GGCTAATCCA TTCAAACACG AGTGGATACT ATTATATACA 720
CTCGTCTGCG AGCACAAACA CTGTAACAAG CAGCCACTTA AACATGTAAA CCTATAACAA 780
ACACACACAC AGCACAGAAG ACACATGCAA ACACACCCAC CCAGGGAGAC ACACACATGC 840
ACACACAAAT TAGAGCACTC GCAACTCGCG AAAGCTAAAT ATTAACCACT TCACAAATAT 900
TACAGGAAGA AAACTCATTG AAGCGCAGGA 930