EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR002-06460 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_24hpf 
Coordinate
chr11:40416001-40417546 
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
LMX1BMA0703.2chr11:40416530-40416541TTAATTAAAAT-6.62
NRF1MA0506.1chr11:40416165-40416176GCGCATGCGCG+6.02
NRF1MA0506.1chr11:40416164-40416175CGCGCATGCGC-6.02
Rarg(var.2)MA0860.1chr11:40416092-40416109GAGGTCACGTAAGGTTA+6.57
Enhancer Sequence
TAAAAACGGT CCTACAATAG ATCTATTATT TACTCAATCG ATTCAAGCTC ACGCCTTCGT 60
GAATTAAATC TATTGTTCGG ACACACATGT CGAGGTCACG TAAGGTTATT TCGTGCCGTC 120
TTGCCCCCTA TGCCCCTTTT TATTCCCCGG TTACACTCGT GCACGCGCAT GCGCGCACAC 180
GCGTCGAGCT GGAAACAAAA GGAGGTAGAG CGCGCGCCAA GACAACGTGC TCGAGAGACT 240
GGGGGCGGGA GGCGCGAACG ATTTACAGCA CGCGGCGGCG ATATTCCCGC CTATTCGAGC 300
GGCAGAGATC AAGAGCCCTG ACTTTACACA CACACACACA CACACAGACA AAAAAATTCA 360
AAGAAAGAAA AAATGGCAGA TGGTTCACCA ATTCACTCCC CCCGATACCC TACACTTAAC 420
GTTAATGGGA TATGATTACA TATGGGAATA GACGTCGAAT TCACTTCTCA CAGAGGTTTG 480
TTTCAATTCT TCACTTACTG TTGAATGAAA ATGTTTTCCT TTTTAACCGT TAATTAAAAT 540
ATGACGCGAA TAAACGGAAA AATATTGCTA ATTGAAGAAA ATAACCATTC ACACATTTCC 600
GTTAAGTAAC GTTATAAAAG AAACCGTTGA GAACACCTCC AACGTTAATC GACAGATTTC 660
TTTTTCTCTT TTTTATTTCC AGGTAAGCCC TTTTACATCA AATACATCGT ATTCAGGTAA 720
ACTTACCTTT GCGGTGATCT CGGAGGTGGT GGTTGTATCA ACAGCGGTAT CGGCCATGGT 780
GGTTTATAGA GATGATTTAA AGAAAAATGT CCGAGAAAGC GTTAAGAGAG GTGGGATGAG 840
GTAGGAGACG GTCGGTCGGA CGGACGTGAG GAGGAAGAGT GAATCAAAAC TGCCTGAACC 900
TGAGAACTGA AAGGCACGTC GAGCGCAGCG GCAACCACAC TGATATCTGA TTGGACAGGA 960
GCACAGCAAC GTAAATCCGT TCTTTGATTT GATTGGTGAA GCCACTGTCG ATTGTCCTCC 1020
CCTTTGCCCG CCTCAGTGTA GTGCGTCCTT CTGGTCTTAT TGGTGGAATA TATAATTTGA 1080
CTCTTTACCC GGTCTTTTAA AATTCATGTT ATGGTTATCG AACAGGCCAG GATCAATTCA 1140
GGACATTCTG CTGACTTTAG GACAATATTT GTATGCTTTA TTTTAGTGTT TTAATAATAC 1200
TGAAAAAAAT TCAGCTTGAT TTGCAGTATA AATATATTTA TATTAGTACA ACTCATACTT 1260
GGGTAAAAAT AGTATATAAT GTGTATATGT GTTTCTAGTT GAGTTCCTCC TTTTTATCAC 1320
ACAAACCTTT TATTATGTGC CTTTTTATCT TTTGATAGCT GTTTTGTGTG GTTGGAACTT 1380
GGCCATCAGT AGTATAAATC ACATTTCATA TATTTATGTA GTACTGTTTT AGATAAAAAT 1440
CGAATATAAT ATTGTTATAT GTGGTTCTGG TTGACTTATT TCCTCTTTAT TCATTTATAA 1500
TTTGGTTTGC CCTTTATTTT GATGTAATCT CTTGATATTT TGTGT 1545