EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR002-06388 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_24hpf 
Coordinate
chr11:38701953-38703753 
TF binding sites/motifs
Number: 11             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CTCFMA0139.1chr11:38702532-38702551TACTGCCCCCTAGTGTTTA-6.54
CTCFLMA1102.1chr11:38702533-38702547ACTGCCCCCTAGTG-6.15
FOXP1MA0481.2chr11:38702000-38702012ATGTAAACAGAA+6.92
FOXP2MA0593.1chr11:38702000-38702011ATGTAAACAGA+6.02
HNF1AMA0046.2chr11:38702822-38702837TGTTAATAATTAACA-7.04
HNF1AMA0046.2chr11:38702822-38702837TGTTAATAATTAACA+7.21
HNF1BMA0153.2chr11:38702823-38702836GTTAATAATTAAC-7.04
HNF1BMA0153.2chr11:38702823-38702836GTTAATAATTAAC+7.12
IRF1MA0050.2chr11:38703247-38703268AATATGAAAATAAAACTGAGA-6.12
LMX1BMA0703.2chr11:38702811-38702822ATTTTAATTAA+6.62
POU4F1MA0790.1chr11:38703031-38703045ATAAATAATTTATG+6.48
Enhancer Sequence
GATCAACACT ACTTTAAAAT GACCATTGAT GGTTATTTCT GTTGAACATG TAAACAGAAT 60
AGGCAATCAG CAGTGTTTAA GAGCATTTAC TTTCACAGCC AGTCACAGTC ATTTCAGTTG 120
TGCACGTTAA CGCAGTGGCC GATCAACTGT GTTTAAGAAC ATGCTCCACA ACGTTCAAAT 180
GTTAGCAGAA AATAGACATT TTAGTAACCA ATGGTAGCGA ACTCGATACT TTTGACAACC 240
CTATTACCTA TAGTGAACAA CTGACCTAAA TTCTTCCCTA AACACAACCA ATTGTGTTTT 300
CAAAAGCAAA CGCAAGTCCA CCGCAGCCAC ATAGTTTAAC TTTGATTTTA CGTTGCTTTT 360
ATGCCTTTTG TTGAACTGTG CTTTACCAGA CTCAAACCCG AGCACTCTGC ATCACAAGTA 420
CAACAATGTA CAAGGTAAGC TACTGAGCAA ACTGACCACA CTAGAAAACT TATATAGTAT 480
TAATTTGGTG TTGTAGAAAA ACGAAAATAA TCATGTATTG GCCGATTATG TCTCTGTAAA 540
AATCACTAGT GTGAAATGGA ACAAAAATAG TTGCCATCAT ACTGCCCCCT AGTGTTTATT 600
TTAGCAAGAA ATTGCAGTCA AATGTATGTT TTTGTGCAGT TTCACAAATA ATGTAGACTG 660
AAGCACGTAT TTCCAATGAG ACGTGTAAAA AATATAGGTA ACTTTACAAT AAGGTTACAG 720
CGATTAATGT TAAAGTTTTT GCCATCATAA ACAATGAACT AAATATTTAT TACAGTTTTT 780
CAAATGTTTG TGTTACTTAA TAAAAAACTA GTTCAGTAAT GGTTTCTTGA TTTACTATGC 840
TAACAACCAA GTCTTTGGAT TTTAATTAAT GTTAATAATT AACATTAATT ATGATTAATA 900
AGTTTTAATA TAGAATTATT GTTCGTTCTT AATTTATGTA GTTAGTTATC TGGCAACAAC 960
AAATAAAGCA AGCCTTATAG TATAATGTTA TCAATATAAT TTCAATATTA ACAAAAAAAA 1020
ACATAATATT ATACGAATAA TACAATTATT AATATTATAT ATTTAATATT ATAATAATAT 1080
AAATAATTTA TGGCAACTAG AGGAAATTTG TTTCATTTAT TCAATTTCAA ATTTATAAAA 1140
AAACACAAAT AAAAAAATTA TCAATTTATT TAATTCAAAA ATATTGAAGA TATCAAAAAA 1200
TTACTAAGAA TTTAAATGAA TCTGAATTTA TAAACACGAG CTAATTCAAA ATATGAATAA 1260
ACTGAACTTA TCGTTCCTAA ATTTTAAGTG CCGAAATATG AAAATAAAAC TGAGAAAATT 1320
GATAAAATCT TATAAAACGG AAAATATTAA AGTAAAATTT ATTTAAAGGT AATTTTCAGG 1380
CCAACTTTAA AGCCAATCAT CATTTGAGGA TGTGGAAATT GAAGATGAAC GAAGCTTAGG 1440
ACGTGCCGTA AATGTACATG CGTTTGCTGG GTTTGCTATG AACGTCCCTG CTGTCCTTTC 1500
ATCGTTTCTG CTCTGGTTTT GAAGCGTGCG TCTTTCCGAG TTTGTTTGAG TGATGATGAG 1560
TGGCAGCTCC TGATGGATGG AGCAGAATAA ACACTGGCTG CGCTTCTTAC CGTGGGTTTG 1620
GAGGTGAGAG AAAGTGGTTT GGATGAGTTT AGCGTTGGCA GGCCTTCAGG GCAGAGCTGT 1680
GATCAAAGAC TATACCGCGG GTCAGGAGGA AAACAAAGCT CACAGCGCTC GAGCGAACAG 1740
GCAGTTTTAG GAGAGAAGAC AGACGGAGAA GTTAAAAGGA CGGGGTCATA AAGAGGCCGC 1800