EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR002-06062 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_24hpf 
Coordinate
chr11:31093962-31095340 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Foxd3MA0041.1chr11:31094163-31094175AAACAAACAAAC-6.32
LMX1BMA0703.2chr11:31095264-31095275ATTTTAATTAA+6.62
NKX2-5MA0063.2chr11:31094422-31094432ACCACTTGAG+6.02
Enhancer Sequence
TTTTGTGTTT GTGTTTTTGT ATGGGGAAAA TGTTGGTAAA AGAAACCAGT AAAAACGCTG 60
CTAACTGTAT AATCATACAT AAAATGAAAT ACAGGAAAAG ATACAGGAAG TAGTTTTTAC 120
CAATTGTGAT CTGATTGTGT AACTAAAGTC AAAGAGCTCC TGTTGTGACA TGTGAATTTC 180
CCTTTGGTAT TAATAAAGTC TAAACAAACA AACAAATGCA AACACTTTAA ACAGACCAAC 240
ATTATATTCT ACATAACACA TCTTGGTTTC ATACGAGACT AAAACATTAC AGAAAAATAG 300
CTGACTCTTA ATTATGGCAT GCAATTGTAT TGGTCTGACT GCCACAAATT AATTTGATCA 360
AATAACTTAA CTGTGAGCTT AAATTTAATA GAAATGATAT TGCTTTTACT TCTTTTTTTG 420
TGTTGTTTTT ATTGTTCAGT ATGAAATGTG CGTCTGTAAA ACCACTTGAG AAGCACAGTT 480
CTGCGGGATG CTGGTTAAAG GTCATATTTT TACGAAGTCT GAGGAGTCCA GGTCTTTTAT 540
TCAGCCTTGA GTGTGTGTGT GTGTGTTTGT TGGTTGAGGT ATTCGGCTGG GATAGTGCAG 600
CAGGGTGTGT GTGTATATGT GTGTGTGCTC GGCTGCTGTG AGGAGCTGAG AATGCCAGAT 660
GGTGCTTGTT AAACTCAAAA AGCTCTCCCA CTCTCGACTG GAGCTCCGCG GTGTGGACCA 720
CATGCTGTCT AGAATGACCA GCCTCAATTC AGACAGGCTG AATTCTCCAA CACCCAAAGC 780
TACCTGCTGC TTCGGTTTTC TCACAGGCCC TTTCAGTCTC CCTTTCAAGT GCAGCATGTC 840
GTCAGAAGCT GACGGTGAAT GAAGGTTACC GCTCGAGCGG GAGAAGAAAT TAGTTCAGCT 900
CTGGGGGACA ATGCGGTTCT GCTTTTACAA AGATGCCCGC TGCTGTCCAA ACCCATAGAG 960
AAACGAGCTG AATGAGAGAA ACAAGGAGGC AGTGTGTTGC AGGCAGGTTT GTGAAAGACC 1020
CTCGGCCTGT TTGCTCCCAG TGACCTTAAA GCAGCCAAGA CAGATTTGGA GTTGTGCCAT 1080
CGATTTCTGT CGAAACTTGC CGTCGAGATC TGTGCGTGCG CGAAACAACC AGTCACCACA 1140
TGTTTGTTTG TGTCTGGTCT TGCCCTGTGA ATGTGTTTTT TTCTACCTAT TTAGTTGTTG 1200
TCAGCAGGTG AACCGCAGAA ATCGAAACTG CTGTCAAACT TTCATGTTTG TCATTCGCCC 1260
TGCAGCTGTA TGCCGTCGTC AACATGCTTT CGCTTTATTC AGATTTTAAT TAAACGAGGC 1320
GCTTGGCCGA ATCACCCTTT ATGCTGTTCC TAAACCCTCA TTGATGTGCG TAAAAAGG 1378