EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR002-05965 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_24hpf 
Coordinate
chr11:29209063-29210210 
TF binding sites/motifs
Number: 5             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
NEUROD1MA1109.1chr11:29209336-29209349GGACAGATGGTGG+6.02
Nkx3-2MA0122.3chr11:29209629-29209642ATTAAGTGTTTTA-6.16
POU4F1MA0790.1chr11:29209604-29209618CATTAAATATTCAT-7.06
POU4F2MA0683.1chr11:29209602-29209618TTCATTAAATATTCAT-7.63
POU4F3MA0791.1chr11:29209602-29209618TTCATTAAATATTCAT-7.36
Enhancer Sequence
ATTTGATTCC TGGGATAAAG CTGGGCATCC ACATCGGCCT AAACATGATA AACAGAACGG 60
CCCTGGGTTC CTCCCGCTGG CTGATTGAAA ATCTGTGTGG CTGCGAGAGG GTGTGTGTGT 120
GTGTGTTTGT GTGTCTCTGT GCGGCCTGAA TGAAGAAACA GCAGAAGAGG CAGACTCCCA 180
GGCAGAAAGG GCAGAACGGA GAGCAGAGAA CAGACTGATT TATGGCTGCA GGTCAGTGCT 240
GTGGCATGTG TGTGACACTA ATGCAGAATG ACAGGACAGA TGGTGGAATG GAAGCAAGAC 300
TCTCAGCTCT TCTCCGTGCC GATTGGAGGA GACTGTAAAT CACACAGGAA GTGGCTTTAG 360
AGAAAGCACT TCATGCGCAT TATAGTTCCC AGATCAATTG ACTTGTCAAT TTAACACTTA 420
ACCCTGGGTT AGCATCTTTT AAGCACCAGG TTAATGCATT TTTTAAACTC TGGTGACTGG 480
GTTCTGCTTT GAAGCCGTTT AGCTAGTCAA ACAATCAACA ACTTTTTTTT AGTTCTTACT 540
TCATTAAATA TTCATAAGCT TTCCTGATTA AGTGTTTTAC TTCAGTGAAA CATTAAAAGG 600
AAACACATTA ACCAGAGTAA TTATTTTTGA GACTCATTTA AGATTTTCTT GTAGTGTTTC 660
AGAAGTCAGA AACTATGAGG CCATTTTCAT CCAATCAATG TTACTATCCT CATAAAAATG 720
CATATTCCAA TGCCATGATT GGATGAGACT GTAAATCACA GGAAGTGGTT TTGGAAAAGG 780
CGCTCTATGC CTATAAGCTC TATAAACTTA ATGCCCGTTA TTCCTATGAT TAACTGAGCT 840
GTCAATTTCA CACAGGTTAA CATCTTTTTA AAACCTTGCT TTTTAAAAGG CCTTTTTAAA 900
TCTCGGGCTC AAGCAACATT TCAGTGGGTT GGTATTGCTT TGAAACCAGA TAACCAATCA 960
TAAACTTACT CTAAATGTTT TGTATTTGCC TAATCGATCT GTTTTTTTGC CTTTAACAGT 1020
TTTACTAACT TCATAAATAT GAAGCATACA AATAAAACTC TGTGATGATT GGTGGAGACC 1080
ATAAATCACA CAGGAAATGG TTCTGGAGAA GGTGCTCCTG ATATACTCTA TAAACCCTTA 1140
TGCCTAT 1147