EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR002-05292 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_24hpf 
Coordinate
chr11:18559741-18561104 
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
IRF1MA0050.2chr11:18560418-18560439TTATGCTTTCTCTTTCTTTAT+6.86
MEF2CMA0497.1chr11:18560860-18560875GATATAAAAATAGCA+6.45
SCRT1MA0743.1chr11:18560899-18560914TACCACCTGTTGAAC-6.93
SCRT2MA0744.1chr11:18560901-18560914CCACCTGTTGAAC-6.57
Enhancer Sequence
CCAGGACCAC TTTTACAAGA TTCTCCACTT AAACTGCGTC TCAGCTGTGA CATGAATTTA 60
AATAATTTGT TATACACAAA ACTTCAAATT TGGAACGTTT ATTGACGTCT GGACATGGGC 120
CTATACAAGA TTCTGACGGT ATGATAACCT TGGATAAGAA TATCATGGTG TTACAGTATG 180
GTGGTTACGC TAAAACTAGT TCCTTTTCAA TGTCTGGGTA AAAAAACAAA ACTTTTTCTT 240
TCTTTTAAAC ACATTATATT TGATTTGGAG AAAACTTAAA ATATTTTGGA GCAGTAAACA 300
TTTCAGGCTA AAGAATTCAA GTGAATTTTT GACTTCTTCT GTCTTTATTT GTTTCAAAAA 360
CACAGATTTC ATTACAATTT AAAACGCCAT TTTTGTATAC CTTCTCTGAC TGAAATACTG 420
CTTAAAAAAA TGTTAAAAAC ATACAAAAAA AAACACAAAA AAAAATTAAA AGTATCGTAC 480
ATATACCATA GGAAAGGTGC AACAGAAAAC TTTTGTGGTC TAAAACACCT TGACCTTTCC 540
AAACGGCGGT ATACCTTGAA AAACTGTAAT CATCCCATGC TTAGTGTGGA CCTGTGTCCT 600
TTGCTTGTGT GTGTATGTGT GTGGAGGAGG CTGAATGAAG AGAAGGAGAC ACTCATGAAG 660
CACATTCCTC CGCTTTCTTA TGCTTTCTCT TTCTTTATTC TTTCTTGACG TTCCCCCCTC 720
CACCCCATCC CAAGCCCTTC ATGAGAAAAT CAAACAGGTG GTTTGGCCCT GTTGGAGGGG 780
CGCGTCTTAC CGAGGTGGGC CGTCCCGCAG CCTGTTGGAG GCACTGAAAG GCAGCGTCTC 840
CTCTCAGCTC CAGCTTGAGT CCAGTGTCCA GTTAAAGAGA GCCACTCTCA TTACCATCTC 900
AATTCTGGGA ACGGGCTAGA GACCTCAGCT GCACCCTAAC AGGCAGCCCA TATGGTGCTC 960
GCTTGGCAAC CGGGCAGGAG GGGACCGATG TAACCCCCCC TCTCCCTTAA ACACATTCTC 1020
TCACACACAC ATACATAAAA GAAGACCTAA ATGACATGTC ATCTATATAT AAACACACTT 1080
AGCATGGATA GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGAAG ATATAAAAAT AGCATTCTTA 1140
TCTTAATGCT TGTAGATATA CCACCTGTTG AACTATAGGC TTTAGAGTGG GCATCAAAGG 1200
GAAGCAGACA GTTAAAGAAA GGCCTGGGGT TCCTGGGGGT GCAAGACCAC ACAGCGCCTG 1260
TATGGAAGGA CGCTTGGCTC TGTGCACTAT ATACTGTGCT TTTGGAGGCC GTTTTACCAT 1320
AAATGGCTTT AGTGGTTACA GACCCCACAG GTCAAAATTA ACA 1363