EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR002-05250 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_24hpf 
Coordinate
chr11:18225633-18227687 
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
HOXD9MA0913.2chr11:18227118-18227128GTTTTATTGC-6.02
IRF1MA0050.2chr11:18225986-18226007TAACTAAAACAGAAACTATAA-6.06
NFIL3MA0025.1chr11:18225970-18225981TTATGTAACAT+6.32
NFYBMA0502.1chr11:18227568-18227583CAATCCACCAATCAG+6.19
Enhancer Sequence
CTCCTCATGA GCCACCAATT AAAACTATTG CTCTGTCTCC TTCATAAAGT CATAAACATG 60
AAAGACTCTA ATGACTTCCC TGACCGTCCT GCTTAGTCTC GATGGACTCT CCCTCTCACT 120
GAGGCTGATC ATTGGACAAA AGAATGACCA CACGAGGGAG GAGTCAGTGC CCATTTCACA 180
CTGCAGCTCG GGCAAACAGC AATCAGTGAG TAATGACAGG AACCCAGCAG GGAGGAAAGA 240
GGAAACCCCC CAAAATGTGC AATTGGTCTG ACTTTGTGGC CTTTTAGTTT CTGATGCATA 300
AATCTGGCGC TGAAGAAAAA GGAATGGAGC ATTTTGATTA TGTAACATGA ATGTAACTAA 360
AACAGAAACT ATAAGACTAT CTGTGGGTTC CTGTGTCAGA AGTAATGTCC TTTTTAATCG 420
ACGAGAAATT ATTAGGTATT CTAAACATCA TTTTGTACCC TGCTCTGTCG TTATACACTT 480
GTTCTCAGCT TAAAAAAGCC AGGAATGTTA ATTTCCAAGC TCTGTCCAAG AAAAGAAAGC 540
TTGATAATAG TGGTGACCTC ATAGACACAG TGATAGCGCT CTGAAACTCT GCCCTCCCAT 600
TAGAGAGAGA AAAAGAGAAA TATTCATCTG GTGATGGAAG ATCTGGAAAT AAAGTGCAAA 660
GGTGCTAATG TAATGGAATA AATTAAGCTG ATTGAGGAGA GCAGTGCTAA CAGAAGAAAA 720
CCTCAGATTG TTTGTAAACA AAAGATGCTG CTTTACCATT CAAATGCAAG TGTTTTGAAC 780
ATTCAAATGC AGAAAGGAGT GAAGGACTCC GAACTCTAAT GTTCTCTAAG TTTTGGTCTG 840
TAATGGAAGC GAAGACCATT CATGAAAATA TAAAAGCCGG CTATATAAGC TCATGTTCCT 900
CAAGCCTAAT AGATCCTGTT GTGATCCTGT TCTCTTTTTG AAGAAAGAGG AAAGCCTGTA 960
TCACAATTTT CACCCAGTGA CTCTCCGATA TGTAAAATAT GCTTTTCCTA CAGTTGTAAG 1020
GACAATAAGA GATTAATAAA AGCCCTTTTC CAGAAGGATG TTGCATTAAA ACCAAATGCA 1080
ATAGCATATT GAAATCAATT CATGAGTGAT GTTGCTTGGA CAAAAGTTTG GCTTCTGCCT 1140
AATCACTCTT AACAAACAAG GTTAAAAAGT CTTTGTTTAA ACTCCTGCAC AGAATATATC 1200
CTGCCAAACT TTATTTAACT AAATTTTACA TAGATATAGA TGTGATATGC AGCTTTTTCA 1260
AACAAAGGCC AGAGAGTGCT GTTCATTTAC TTTGGTATTG CTCTTATGTG TCCTTTTTTA 1320
TTGGTGAAAT GTAATTCACA GTATTGCTGT CAGTATTGAT TACAATATTC TTTTAGGATT 1380
TTTTTAAACT CTAGAGACAA AAGACCCATA CACTTTTTAG TAATTACTTT ATTTTAATGA 1440
CCAAATTTCA TATTCATAAA TGTACATTTT CAGGTAAAAT TCCATGTTTT ATTGCAAAAA 1500
AAAAATGATG TGAAGCATTA CAGTGCTTCC GGAAAGTATT CATAGTGTTT CGCTTTTTCC 1560
ACATTTTTTA ATGTTGCAGT CTTATTCCAA AATGAATTTA TTTATTTTCT CAAAATTCTA 1620
CACACAAAAT CCCATAATGA CAATGTGATT TTTTTTAAAT TGTTGCAAAT TTATTAGAAG 1680
TAAAAAACCT GAAAAAATGT ACATCAGTAT TCATAGCCTT TGGCGTGAAG CTCTAAATTA 1740
AGCTCAGGTA CATTCTGTTT CCACTGAACA TTCTTAAAAT GTTTCAGCAG CTTAAGTGGT 1800
GTTCACTTGT GGTAAATCCA GTTGATTGGA CATGATTTGA AAAGGCATCC TCCTGTCTAT 1860
ATAAGGTCCC AGGGTTGATA GTGCATGTCA AAGTACAAAC CAAGCATTAA GACAAAGAGA 1920
CAGCCATCTG TGCAGCAATC CACCAATCAG GCCTGTATGG TAGAGTGGGA AACAAAATTC 1980
TCTGGTCTGA TGAGACTAAA ATTTAACTCT TTGAAGTGAA TGCCAGGCGC TACATTTGGA 2040
GAAAAGCAGA CACC 2054