EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR002-05190 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_24hpf 
Coordinate
chr11:16293008-16294513 
TF binding sites/motifs
Number: 12             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOXE1MA1487.1chr11:16294376-16294391TGCTAAATAAACAGC+6.04
PHOX2AMA0713.1chr11:16293603-16293614TAATTAAATTA-6.62
POU1F1MA0784.1chr11:16294267-16294281AATATGCTAATTAA+7.25
POU2F1MA0785.1chr11:16294267-16294279AATATGCTAATT+6.52
POU3F1MA0786.1chr11:16294268-16294280ATATGCTAATTA+6.44
POU3F2MA0787.1chr11:16294268-16294280ATATGCTAATTA+6.62
POU3F3MA0788.1chr11:16294267-16294280AATATGCTAATTA+7.04
PROP1MA0715.1chr11:16293603-16293614TAATTAAATTA+6.32
PROP1MA0715.1chr11:16293603-16293614TAATTAAATTA-6.62
Phox2bMA0681.1chr11:16293603-16293614TAATTAAATTA-6.62
ZNF143MA0088.2chr11:16293900-16293916TTCCCAGAGTGCACTG+6.22
ZNF24MA1124.1chr11:16293091-16293104TATTCATTCATTT+6.42
Enhancer Sequence
AAAAAGAAAA AAAAATCAAA GGGGGACTAA TAATTCTGAT TTCAATATGA AATATTGAAT 60
ATATAAATAA ACTATAAATA TGTTATTCAT TCATTTTCTT GTCAGCTTAG TCCCTTTTTT 120
TAATCCGGGG TCACCACAGC TGAATGAACC GCCAACTTAT CCATTAAGTT TTTTACACAG 180
CGGATGCCCT TCCAGCCACA ACCCATCTCT GGGAAACATC CACACACACA TTCACACACA 240
CACACACACT CATATACTAC GGACAATTTA GCCTACCCAA TTCACCTGTA CCACATGTCT 300
TTGGACTGTA GGGGAAACCG GAGCACCCAG AGGAAACCCA CGCAAAGGCA GGGAGAACAT 360
GCAAACTCCA CACAGAAACT CCAACTGAGC CGAGGTTCGA ACCAGCAACC CAGCAACCTT 420
CTTGCTGTGA GGCGACAGCA CTACCTACTG CGCCACTGCC TCGCCTTATG TTATTTATTA 480
TTATGTTATT TATTATGTTC TCATACTTAA AAAATATAGA AGAGAAAATT TACAATTATA 540
ACAAAATAAC TATTTTTGAA TACAAAATAA AGAGTTTTTA TATTATGTTT TATAGTAATT 600
AAATTAAACC ATAAATCTAA AACAGTTCTC ATACTGTATA TATGTTAATA AATACAATTC 660
AGATTATTTA TAATGTATTG GATTTTAATA AACTCCATAA AAGCAAAACT TGCTATTATT 720
AATTCATGTT AACTAAAATA GTTGAACAGA ACTAATAGCA CAACACTACA TAAAGTATAA 780
TAACTATGTA ATAACACAAA ACACTATAAT AGCTACTCAG TGATCCTCTC GTCATTCAAT 840
CTACTTGAAA AGATTCTCTC TTCAGTTTCT CCACACTAGA GAGAAAGATT ATTTCCCAGA 900
GTGCACTGCT CATCCCACTG CTTGACCCTC ACCTCATAAT CACCACCTCT GACAAAACAA 960
CCAGTTTGGC TCTTCTTTTC CCTCATGCTG ATCTGAGACC TGTTATTCTG ATAACAGCAG 1020
CACTCTGGTA AAACACTCTC AATAGAGGTG ATTTTTTCCA TTGATTGCTG CAGCTGCAGA 1080
GCTTATGACT GTCAAACCCT GAGGCCCCTG TTGTGGATAA TGGGGTAATG GTTGCCACCT 1140
TCTCAGCACT TGTGGCCCGC AAGCAGTGTC AGAGACTGAA AAGATCATTT CAACACTTGC 1200
TGACAATTTG TGAGGAATAT GTCTGTGTAC TGTAGGTACA CTTTTGACTA TCCATTAGCA 1260
ATATGCTAAT TAATTCAAGC CATATCATAA ATGTATGCTA GAAACATCCT TTGGAGGTCA 1320
AGCCTTCAAA CTTTAGCCAA AAAAGTGTAA TAGCTAAAGC TAAAGTAATG CTAAATAAAC 1380
AGCTTTTGTG GGAAAACTAC TAATAATTTT CAGAATTAAC AGCATACGGG ATACTTAACA 1440
TAACAATAGT AGATCAGCCA GCCATCCCAA CTATTTTAAA TTGTGCAAGC AGCATGCCAA 1500
GTCAT 1505