EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR002-04938 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_24hpf 
Coordinate
chr11:9491876-9493028 
TF binding sites/motifs
Number: 13             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Arid3bMA0601.1chr11:9492792-9492803TTAATTAATAT+6.62
BHLHE40MA0464.2chr11:9492334-9492344ATCACGTGAC-6.02
FOXE1MA1487.1chr11:9492927-9492942TATTAAACAAACAGA-6.03
HNF4GMA0484.1chr11:9492033-9492048TGAACTTTGCACCGC+6.01
LMX1BMA0703.2chr11:9492789-9492800AATTTAATTAA-6.32
NR2C2MA0504.1chr11:9492011-9492026GCAGGTCAGAGTTCA-6.16
PHOX2AMA0713.1chr11:9492788-9492799TAATTTAATTA-6.62
PROP1MA0715.1chr11:9492788-9492799TAATTTAATTA+6.32
PROP1MA0715.1chr11:9492788-9492799TAATTTAATTA-6.62
Phox2bMA0681.1chr11:9492788-9492799TAATTTAATTA-6.62
SREBF2(var.2)MA0828.1chr11:9492334-9492344ATCACGTGAC-6.02
Srebf1(var.2)MA0829.1chr11:9492334-9492344ATCACGTGAC-6.02
TFEBMA0692.1chr11:9492334-9492344ATCACGTGAC-6.02
Enhancer Sequence
TGCGAAAAGG GACAGGATTA AACAAGATGA TTAGACATTT AAAAAGTGTG CGATTGCTCC 60
ATATTTTAAA TTTCTGTCCA GAAAGGTCAT GTTTTGATCC TCGATTGGTC TCACGCAGTC 120
AAGTGATGCG ATTTCGCAGG TCAGAGTTCA CCAAACTTGA ACTTTGCACC GCAGCAACCT 180
GCAAAACTTA ATGCAAGACC CCGCGTTTCT GGTCTGAAGC ATTCGCGTGC ATATGAATGA 240
AAGTCTATGG CAGGAAAAGT CCAGTGTGAC CGCAGCTTTA CCTGTAGGTT TCAAGCAAGC 300
CTAAAGGACT CAATTGGTTT AATCAGGTGT GTTTAGAACT AAACTGTGCA GGGCTGCGGC 360
CCTCCAGGAA TTGAGTTTTA CATCCCTGTT CTATACAGTA TGAATGTAGG CCTTATGAAA 420
AAACCTTGGA TGTACTACAT CTGCCATTTT GTCATGTCAT CACGTGACTT ACCCATGTGA 480
GTTACAATTT AACCCTGCAG AAAAATCCAG CTTAAACCAG CCTAGGCTGG TTGGCTGGTT 540
TTAGCTGGTC GAACAGGCTG GTTTTAGAGG GGTTTTGGCC ATTTCCAGGC TGGTTCCCAG 600
CCATTTCCAG CCTGGTCTTA GCTGGTCAGG CTGGAAACTG ACCAGCTAAA TCCAGCTAAA 660
ACCAGCTTGA CCAGCCTGGT TTAAGCTGGA CATAGCTGGT TTTGGCTGGG CTCCCAGCCT 720
GGCTAGGCTG GTCAAGCTGG TTTTAACTGG TCATCTTCCA GCCTGACCAG CTAAGACCAG 780
GCTGGAAATG GCTGGAAACC AGCCTGGAAA TGGCCAAAAC CCCTCTAAAA CCAGCCTGGT 840
CGACCAGCTA AAACCAGCCA ACCAGCCTAG GCTGGTTTAA GCTGGATTTT TCAGTAGGGA 900
AGTTGTAAGT TCTAATTTAA TTAATATTCA AAATTGAGTT TTTGAAAAAA ACATACAATA 960
TACATGCTCT TTACCTTTTA AGATGGGAAT TCCTTGAACA AGGACAGCAA TAAATTGGGT 1020
CATTATGGCA TCTAAAATGC TGAAATTCTT GTATTAAACA AACAGAGCAT ATACACATAA 1080
CCAACGTCCA AAGACAGTGG CTGCGTCCAA AATCTAATTT TTCCATACTA TATAATATGC 1140
TAAAATCAGT AT 1152