EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR002-04524 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_24hpf 
Coordinate
chr11:285483-285993 
TF binding sites/motifs
Number: 35             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
RFX1MA0509.2chr11:285599-285615AGTTGCTATGGTAACA+6.54
RFX1MA0509.2chr11:285756-285772AGTTGCTATGGTAACA+6.54
RFX1MA0509.2chr11:285599-285615AGTTGCTATGGTAACA-6.55
RFX1MA0509.2chr11:285756-285772AGTTGCTATGGTAACA-6.55
RFX1MA0509.2chr11:285704-285720CGTTGCTATGGTAACA-7.26
RFX1MA0509.2chr11:285704-285720CGTTGCTATGGTAACA+7.27
RFX2MA0600.2chr11:285653-285669AGTTGCTATAGTAACA-6.33
RFX2MA0600.2chr11:285653-285669AGTTGCTATAGTAACA+6.35
RFX2MA0600.2chr11:285599-285615AGTTGCTATGGTAACA-6.82
RFX2MA0600.2chr11:285756-285772AGTTGCTATGGTAACA-6.82
RFX2MA0600.2chr11:285599-285615AGTTGCTATGGTAACA+6.86
RFX2MA0600.2chr11:285756-285772AGTTGCTATGGTAACA+6.86
RFX2MA0600.2chr11:285704-285720CGTTGCTATGGTAACA-7.42
RFX2MA0600.2chr11:285704-285720CGTTGCTATGGTAACA+7.51
RFX3MA0798.1chr11:285653-285669AGTTGCTATAGTAACA+6.16
RFX3MA0798.1chr11:285599-285615AGTTGCTATGGTAACA-6.48
RFX3MA0798.1chr11:285756-285772AGTTGCTATGGTAACA-6.48
RFX3MA0798.1chr11:285599-285615AGTTGCTATGGTAACA+6.73
RFX3MA0798.1chr11:285756-285772AGTTGCTATGGTAACA+6.73
RFX3MA0798.1chr11:285704-285720CGTTGCTATGGTAACA+7.28
RFX3MA0798.1chr11:285704-285720CGTTGCTATGGTAACA-7.44
RFX4MA0799.1chr11:285599-285615AGTTGCTATGGTAACA-6.28
RFX4MA0799.1chr11:285756-285772AGTTGCTATGGTAACA-6.28
RFX4MA0799.1chr11:285599-285615AGTTGCTATGGTAACA+6.69
RFX4MA0799.1chr11:285756-285772AGTTGCTATGGTAACA+6.69
RFX4MA0799.1chr11:285704-285720CGTTGCTATGGTAACA-6.84
RFX4MA0799.1chr11:285704-285720CGTTGCTATGGTAACA+7.1
RFX5MA0510.2chr11:285653-285669AGTTGCTATAGTAACA-6.66
RFX5MA0510.2chr11:285653-285669AGTTGCTATAGTAACA+6.67
RFX5MA0510.2chr11:285599-285615AGTTGCTATGGTAACA-7.13
RFX5MA0510.2chr11:285756-285772AGTTGCTATGGTAACA-7.13
RFX5MA0510.2chr11:285599-285615AGTTGCTATGGTAACA+7.14
RFX5MA0510.2chr11:285756-285772AGTTGCTATGGTAACA+7.14
RFX5MA0510.2chr11:285704-285720CGTTGCTATGGTAACA-7.56
RFX5MA0510.2chr11:285704-285720CGTTGCTATGGTAACA+7.69
Enhancer Sequence
GGCTAGCTTC AGTCATCAAG CGCACATGAC CAAACACTAT CTTACAGTAA ACACTGTAGT 60
GTTGATGAAC CATACTATAC TAAAGCACTT GAGTTAAGCT GCTGTGGTGA TTCTACAGTT 120
GCTATGGTAA CACAACAACT ACAGTAATTG ATCTGCTGTG GTGATTCTAC AGTTGCTATA 180
GTAACACAAC TACAGTAATT GATCTGCTGT GGTGATTCTA CCGTTGCTAT GGTAACAACA 240
ACTACAGTAA TTTACCTGTT GTGGTGATTC TACAGTTGCT ATGGTAACAC AACAACTACA 300
GTAATATAAA CAAATGAGCC AGTACTGTAG TTGTCTCCAG CTATAGGGTA TATTATTCTG 360
CTTTACACCA CAGTTTACTG TAGTAAAAAG TAAAGTACAC TACAGTGTTT ATTACAGGTT 420
TTTGCACTAC AGTAAATACT ACAGTGTGAT GGAGCTGGAG CAACACTCCT GTATGCTGGA 480
CTGTTGTAAA TACCATAATA TATACTGCAG 510