EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR002-03399 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_24hpf 
Coordinate
chr10:22799097-22800453 
TF binding sites/motifs
Number: 17             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Alx1MA0854.1chr10:22800280-22800297TGAATTAATTAATTATT+7.27
BHLHE40MA0464.2chr10:22799872-22799882ATCACGTGAC+6.02
Lhx3MA0135.1chr10:22800300-22800313AAATAATTAATTC-6.22
Lhx3MA0135.1chr10:22800281-22800294GAATTAATTAATT+6.29
Lhx3MA0135.1chr10:22800263-22800276AAATAATTAATTT-6.78
Lhx3MA0135.1chr10:22800282-22800295AATTAATTAATTA-6.78
Lhx3MA0135.1chr10:22800285-22800298TAATTAATTATTC+7.12
POU4F1MA0790.1chr10:22800286-22800300AATTAATTATTCAA-6.8
POU4F2MA0683.1chr10:22800284-22800300TTAATTAATTATTCAA-7.4
POU4F3MA0791.1chr10:22800284-22800300TTAATTAATTATTCAA-7.29
POU6F1MA0628.1chr10:22800283-22800293ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr10:22800283-22800293ATTAATTAAT-6.02
SREBF2(var.2)MA0828.1chr10:22799872-22799882ATCACGTGAC+6.02
Srebf1(var.2)MA0829.1chr10:22799872-22799882ATCACGTGAC+6.02
TFEBMA0692.1chr10:22799872-22799882ATCACGTGAC+6.02
USF2MA0526.2chr10:22799870-22799886ACATCACGTGACCACC-6.03
ZSCAN4MA1155.1chr10:22799910-22799925TACACACACTGTCAT+6.18
Enhancer Sequence
TCTTACCAAA ATAAATATTT ACTAATTACC CATTATTAGT TGTATAATAC TGCCATACAG 60
ACCCAGCTAC TTTAACTCAC TCTGATATAC TGTCTGATTG TAACAGTAAA ATGTTGTTGC 120
AATATAAGTG ATGCTGTTTT GGATTATGAA AAGTTCTCCA TGAATAAACT TCACTAAATA 180
ACTAGGGCTG TAATATAATA TAAAATTTCT TTTTTTTTTT GTACACTATA CAATTTGGCC 240
ATTTGTTTTG GGTCTGATCA GTGTTGGGAG TAATGCTTTA GAAAAGTAAT GCATTACAGT 300
AACTAATTAC ATATAAACAT ATAACAAACC CAGGCTCATT CTGAAAACGT ACCGCTATAT 360
AGATTTCTTA AGAGCGCCAA ATATTTTCAA GGTGCTACTT TTTTGTGGTT TTTGTTTTCG 420
CAAATCCACC AAAAGCCACA ATGTATGCTT TTTGAGATCT CAAATTTCTC TCGTGAGTGC 480
CATTCACGCC TACTGTTCTC GCGTAAATCC ACCAGAGGCT AGTGTTGGGT CGATAGACTA 540
TGCCAACAGA GGATGGGCGG AGGATCGCGA TGCCAGCTCA GCATCGTGAC GTCTACCGCC 600
CACCTTCGCC CTTCGATCCT TCGCCCCGCC CTCGTCGCAA ACCCACTCAC GGAAAATACA 660
CACTTAGCCC TTATTTACAC AGCTAGTTTT AAAATGGCAT TTTAGAACGA AAAAGATCCA 720
CATCCACATT GGCGTTTCAT CTAGCATTTG TGAACAGCCC TCCGTCTACA CGCACATCAC 780
GTGACCACCC ACACACACAC ACAGATACAC AGATACACAC ACTGTCATGC AATCGTCTGA 840
GCTCCAGCCT AGGCAGTCAG CATAAACTAT CAGGTAACGT GTTACAGCGT CAGTACAATG 900
CTTCAATCTT TCGCTTTCAC TTAGTAATTT TAGTGAAAAC CCCAGATACT GTTTGGTTGA 960
TTGCTGTTGG TTGTGCAACT TTTTTTACCA ACCAAGTTTG TTGACGCCAT TAATGACACA 1020
GATCACGCTG CCTATTCATG CCAGAGTCCC ACGGAAAAAA AGCGATTGAC AGGTGGTAAT 1080
TAGTGAGTAA ATTATCTCTA TTTGTTAATG ATTTGGTTAT GGGTAAAACA GACCTTGCGG 1140
GTCAGGTAGT TGAAACAGTA GGCAACAAAT AATTAATTTG TTATGAATTA ATTAATTATT 1200
CAAAAATAAT TAATTCACCC GATGCCATCG TCCATCACAA TGTTTTACAT TAGACATCGT 1260
ACGATGCCAA ATTGGTCAAC ATCACCCAAC CCTACCAGAG GCCACTCTCG ACTGACTGAG 1320
GCAATGACTG TCTAACCCCA ATTCTCCTTC CCTAAA 1356