EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR002-03110 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_24hpf 
Coordinate
chr10:15367961-15368575 
TF binding sites/motifs
Number: 19             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Alx1MA0854.1chr10:15368159-15368176AATAATTAATTAATTCA-7.27
BHLHE40MA0464.2chr10:15368515-15368525GTCACGTGAT-6.02
Lhx3MA0135.1chr10:15368180-15368193GAATTAATTATTT+6.22
Lhx3MA0135.1chr10:15368162-15368175AATTAATTAATTC-6.29
Lhx3MA0135.1chr10:15368161-15368174TAATTAATTAATT+6.78
Lhx3MA0135.1chr10:15368158-15368171GAATAATTAATTA-7.12
NR2F1MA0017.2chr10:15368001-15368014CAGAGGTCAACAG+6.44
PBX2MA1113.1chr10:15368294-15368306CCTGTCAATCAC-7.22
PBX3MA1114.1chr10:15368291-15368308CCACCTGTCAATCACTT-6.14
POU4F1MA0790.1chr10:15368156-15368170ATGAATAATTAATT+7.82
POU4F2MA0683.1chr10:15368156-15368172ATGAATAATTAATTAA+7.91
POU4F3MA0791.1chr10:15368156-15368172ATGAATAATTAATTAA+8
POU6F1MA0628.1chr10:15368163-15368173ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr10:15368163-15368173ATTAATTAAT-6.02
SOX10MA0442.2chr10:15368226-15368237GTCTTTGTTTT-6.14
SREBF2(var.2)MA0828.1chr10:15368515-15368525GTCACGTGAT-6.02
Srebf1(var.2)MA0829.1chr10:15368515-15368525GTCACGTGAT-6.02
TFEBMA0692.1chr10:15368515-15368525GTCACGTGAT-6.02
ZNF384MA1125.1chr10:15367967-15367979TTTTTTTTTAAA-7.22
Enhancer Sequence
GAAAACTTTT TTTTTAAACA AACACAGACT CAAAGAGAAC CAGAGGTCAA CAGGGAGATT 60
GCAAAAGACC AGCTTCCGCT TTAAACTAGA ATGACTAAAT ATCTACAATT AAATGTCTAC 120
TAAGGGTGTC ACGATCCTCC AAATCCTCGA TTCGATTACA TTTTCGATTC TAAAGGCACG 180
ATTCGATTTT CGATAATGAA TAATTAATTA ATTCATGACG AATTAATTAT TTGTAGCCTA 240
CCGTTTAAAC TACCTGACCT GCATGGTCTT TGTTTTACCC ATAAACAAAT CATACAGTAA 300
ATGAATAAAG GCAAGATACA CACATAATTG CCACCTGTCA ATCACTTTTT CTGCGCGACT 360
CGTGAAAAGG CAGTGATCTG TGTCGTTATA ATGGCGTCGG TAAAAAAAGA TGCACTACCA 420
ACAGAAACCA GCCAACAGTA TCTGAGGTGT TCGCTAAAAT GACTAAGTAC AAGTAAGTGA 480
AAGATTGAAG CAGTCCTCTA ACTGCCTGGA CCTGCTGTCG AGCGCATGGC TGTGTGTGCG 540
TCTGTGTCTG TGTGGTCACG TGATGTGCCT TTTCAGAGAT AGAGATGAAG GAGGGCTGCT 600
CAGAAATGCT AAAC 614