EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR002-02751 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_24hpf 
Coordinate
chr10:6008898-6009660 
TF binding sites/motifs
Number: 11             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
ALX3MA0634.1chr10:6008924-6008934TTTAATTAGA-6.02
ARGFXMA1463.1chr10:6008924-6008934TTTAATTAGA-6.02
NFYAMA0060.3chr10:6009153-6009164TCTGATTGGCT-6.32
RFX1MA0509.2chr10:6009125-6009141TGTAGTCATGGTAACG+6.86
RFX1MA0509.2chr10:6009125-6009141TGTAGTCATGGTAACG-6.86
RFX2MA0600.2chr10:6009125-6009141TGTAGTCATGGTAACG+6.32
RFX2MA0600.2chr10:6009125-6009141TGTAGTCATGGTAACG-6.37
RFX3MA0798.1chr10:6009125-6009141TGTAGTCATGGTAACG+6.17
RFX3MA0798.1chr10:6009125-6009141TGTAGTCATGGTAACG-6.26
RFX4MA0799.1chr10:6009125-6009141TGTAGTCATGGTAACG+6.53
RFX4MA0799.1chr10:6009125-6009141TGTAGTCATGGTAACG-6.56
Enhancer Sequence
CCTAAATTCA GTATTTAAAT CTCATATTTA ATTAGAAAAT GTGGCAACGA ACTGCAAAAC 60
GGTATTGTTT TTTAAGTAAA AAAGAATTAC CCCTTACAGC AGGCTGGTAA ATGGTTATAA 120
ATATTACTTT GAAAGCCTGT AAGACACACT GTGTGCTTTA CATGAGGCGC TGACAGAAGT 180
TCAGCGCGCA GAGATGAGCT GATCCTCCGA TATGATGTGT GTGTTCTTGT AGTCATGGTA 240
ACGCCGTTCG CGCGCTCTGA TTGGCTGCTG CTCTCTCAGA CACGCGCTGT GATTGGCTGC 300
TCTTCTCTCA CCATACACCG TCACTCACTC ACACCATTGA ACCACTTTGC GCACCTCGTC 360
CATTGACCCT CCTTTTTTGA GCGCTGATTG GTTGAGAACC AGAGGAGGGC GGGAAAATGA 420
GGACCTTCAG AACTGCTTCT GTGTTTTGAT TGGCCGCCTG AAAAGCGCTC AAGAAACTGA 480
AGCTCGCCCT GCACAGGTAT CGTCCGCTTG TAATGTATAA ATAGTATGTC TGTATTACCG 540
CTTCACTTAA TGACAAGCGA CGGTTAGCAC CTCAGGAACT GAAGTCTGCA GGTAAGTCTG 600
AGTTAACTTT AACATTAGAC ATTTTATAGA GATTTACAGC TGAACTGCAT TTATTTCATC 660
CAAATAACTG AAGTAATTTC CTCTTTAGTA TGTAAAGAGT GTTACTTAAT ATTTTAAAAA 720
GGCTTTATGT TTATTAGTGA CCAAATCTCT CATATATTTT AC 762