EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR002-02341 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_24hpf 
Coordinate
chr1:56517222-56519106 
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Lhx3MA0135.1chr1:56518726-56518739CATTAATTAATTA-6.46
POU4F2MA0683.1chr1:56518782-56518798TTCATTAAATATTCTT-6.33
POU6F1MA0628.1chr1:56518727-56518737ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr1:56518727-56518737ATTAATTAAT-6.02
Enhancer Sequence
AATTGTATTA TAAGCCTCAT TTAATAAAAC AGTTAAGACT TGTTTCATAA TGAGTTTAGT 60
TTATTTAACT AACTTAACGT TAACGTTACA GTGAACAAAA TTAACGTACA TGATGGTGAC 120
TAACGTAACC GTAACGTTAA CTTAAGTGAA GGTCAGAGCT TACCTTAACT TTAGTCATTT 180
CACCTTTACT TCAGTCTTGT ACTGAAACAG AAAATGCAGT TAACAAGAAG TTAATTAAAG 240
AAAATTTCCT TTTTTTTCAG GAACTAACGT TAACGTTATG CTAATAACAA GTTACCTCAG 300
AAAACACTAC AATCACCATC TGGCGTCGTT AATTTCTTGT TTTAAAAAAA GGCGCGCTTA 360
AACCCTGTAC GTGCGAGTAC AACTAAAGTA CTCGGTAAAT TCCTGTTAAA TGACATGCCC 420
TATACAGAAA TACACATACA ACAATCATTT AACGGACAAA AGTCATATTT AAACACTTAC 480
CGAGGATGAA TCCGTTGGGT GAAGAGACGA CGCAGGCGTT GTCGTGATGG CGCTTGTTTG 540
CGTTCGAGTC GAGTCAGTTC TGTTCAATGA ATCGGCTCTT TTAAGTGAAC AGTAAAGAGT 600
CGAATTCGGC TCCTTTAAGT GAACAGTAAA GAGTCGAATT CGCCTGAAAA CGATTCCGTT 660
TTGTATAATA TTGTAAGACG CAAACATATA ATTCATTAAT ATTTCATCAT ATTGCTTGGT 720
TCGTGTACTG CTTGAACACG AATTGCTTGT TGATGACTAT GAGCTCATGA ACACGTCTGA 780
TAAAATATCT GAATCTGATT CAATGTCACA CGAGTCCTGA ACCGAAGCAG TGCAAAAGTA 840
ATATATTGAT TGAAATATAA AGTTAATTAT TTTCTTCGCC ATTCAAAATA TTACATATTT 900
CTGACTTCAA CAATAAGAAT AAAGTTCGGT TTGAGTGTAT TGAGAATTAT TATTTTTTCC 960
TCCCAGGATT CATTTCGCAC CAAGCTGCAT CAAGCTGTAA TGGTGGATGA GAAGGCACAT 1020
AATATTATAA ATAGTGCTTG TAATATGTAA TGAAATAAAG TTTTAACACT TTTTCATGCG 1080
AGAATGTAGT TCTTCAAAAC ACAAATCTGT GAATTGTTAG TAAAGATTGT GTGTAATTTT 1140
AAGTGTGTTT TGCCGGTAGC GGAGATCTAT GACCTCCAGG CGGTAACGGC GCTCATTACT 1200
CATGTATCCG CCGAGAGGCG CCTGTCTTCA GGCTAGACAA TGGGACAATT GCCCCGTCTT 1260
CGATGGCTCT ATATGCGTCC GAAAATGAAG TTTTAACTGT TTTTCATGCT AGAATGTAGT 1320
TGTTTAAAAC TCTAATCTGT GGTTTATTTA TATAGATAAA AATAATAATA ATTTATATAT 1380
ATATTTAATT CTGAGTTTAG TGACCTCCAG GCGATGACAG GTGCCCAATA CTCATGAAAC 1440
CGTCTAAAGC AGACATTTAC CCTGACATTG AAATAATTGT TGGCTGTTTA ACAGTCTTTG 1500
GTTTCATTAA TTAATTACTT TTTATTCCAG TTTATTATGT TTTGGCTAAG CACACAGTTG 1560
TTCATTAAAT ATTCTTTCCT ATTCTATGTT AACTGTATAA AATTAAATAA AGGTGCAGTA 1620
CAACCAAAAA GATGTTGGTA ACCAAATCGT TTTGGGGCTA AAAACATTCT GTTATTATCT 1680
GTTAAAAGTT CATTTGTATT AATTTCTACG TTGAGTTAAA AAAAGGTTTG AATTTCTATA 1740
ACTAACGTGC AAAAGATATA GCCCTTTTCA CAGTAATTGG CTGTAATCAT GCTACCTGCC 1800
GTTATTTCAC AATAAAATTA TGAATACAAC ATATTACTGT GAATTTTTCA GTTAAATACT 1860
GTGAAGGGAT ACTAATGTAA TTTA 1884