EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR002-02340 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_24hpf 
Coordinate
chr1:56394850-56396854 
TF binding sites/motifs
Number: 13             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
BHLHE40MA0464.2chr1:56395582-56395592ATCACGTGAC+6.02
CUX1MA0754.1chr1:56395919-56395929TTATCGATTA-6.02
CUX2MA0755.1chr1:56395919-56395929TTATCGATTA-6.02
HNF1AMA0046.2chr1:56395812-56395827AGTTAATGATTAAAC-6.31
HNF1AMA0046.2chr1:56395812-56395827AGTTAATGATTAAAC+6.64
HNF1BMA0153.2chr1:56395813-56395826GTTAATGATTAAA-6.07
HNF1BMA0153.2chr1:56395813-56395826GTTAATGATTAAA+6.48
ONECUT1MA0679.1chr1:56395918-56395932ATTATCGATTATTA-6.17
ONECUT2MA0756.1chr1:56395918-56395932ATTATCGATTATTA-6.32
ONECUT3MA0757.1chr1:56395918-56395932ATTATCGATTATTA-6.05
SREBF2(var.2)MA0828.1chr1:56395582-56395592ATCACGTGAC+6.02
Srebf1(var.2)MA0829.1chr1:56395582-56395592ATCACGTGAC+6.02
TFEBMA0692.1chr1:56395582-56395592ATCACGTGAC+6.02
Enhancer Sequence
CAAGTAGAGG CAATGTCACT TAAATTCAAC AAACGTATAA TAAAGTAATG CTTAGTTTAC 60
TTATTAATAT CTCATTATTC ATGAACTGTT ATTCTAAAGT GTCACCTGAT TAACACACAC 120
TGATGTTGTG CATTAATAAT CTGCAGATGT GTAAAGATCT TCCTAACACT AAGAGCTGTT 180
TAGGGTGATG TACATTTACT GTTGATGAGT GTAGAAGTGA TGATTAATGC TGGATTCTAG 240
ATAGATTTGA TGCTGATGTG GCTCAGAATG GCTCCTGCTC TTCATCTGAT CTTTCTGCTC 300
ATCATTCACA GTGAGTCAAT CTTACATTCA CATCACTGCT TTATTTCTCT GCATTTACAC 360
ACACCACACA ATCAGACATT ATCAGCCATT TTCTAATGAT CTGCTGATCA TCTTCTCTCT 420
GATATAGGAA GTTAGGCTGA AGAGAGTCTT TAGTTAAAGT GTCATGAAAC CCTCCAGTTT 480
TAGCAGTTTT TTCACACCAC TGGTTTCAGC TGTGATGCAC TGAAGTGCTG ACACAGGTCA 540
CACTTTATTT TAATGGTCTG TTTGTTGAAT GTAAGTTACA TTGCATCTAC ATGCCAACTA 600
AGGCCCCGTT TACACTATTG CGTTTTAGTT TTAAAACGGC GTTTTAGAAT GAAAACGATC 660
CGCGTCCACA CTCGCGTTTT ACCCAGCGTT TCTGAACTGC TCTCCGTCCA CACCAAAACG 720
CTGAAAACGC ACATCACGTG ACCACACACA CACTCTTTGG CAATCGCTGG AGCCCATCTA 780
CCCAGATGAG AGCTCTGCTA GTCGGACTTC TCATCAAGCA TCTCCCGCTG GATCTAATCT 840
CACTATTAAA CGGGATATTT CATTCATGTT GTTGTCTTTA TCTAACGACA TATTCCCTGA 900
CTTTGGTCAT TGGAATCTAT TACTTGTTCT CAGGTAACGT GTTTTGGCTG AGCGCAAAGA 960
TAAGTTAATG ATTAAACCAC GTAGCCTACA TTCTGTATAT TGACTGATCG CTTGCCTTTA 1020
TTTCCTGTAA TGTATAAACT TATTGTATGT TATACTTTTA TAATGGCCAT TATCGATTAT 1080
TAAAACTGGT ATTCAGCAAA AGAGAGGGTG TGTTTCGTAT TTTCATTGAA ATTGAAAGGA 1140
GGCAGTGTTG TTATCGGCTC CGTTTTGTTA TAAATATCCA CACAGTGAAG ATGACGCTCA 1200
TGCAGCACGA CACCTCAACA TTTCTGCTGT CTGTTTGTTA ATATTAAAAT AAAAATAGGC 1260
AGTTTCTTAT ATCAAGTTTA CATTTTATTG TTGAGAAAGT GAAACAACGT AGCCAGGGTG 1320
ATGTGAATGA AGTTATAAAG TACACTGTTC CCTGTGAAGA TTGACGCGTG TCCTCGGTAT 1380
GTTTTCCATA TCAAACTGAG AAGAAGAGAT GCAGCCTTGA TCAAACTTGC GAAGTCTGAA 1440
CTTACACGGA GAAGATGCGG GACTGAACTG TGTGTGGGCT ACTTAATATT GAGGAAAAGC 1500
CCCTATCAGA GAGGCGAATG TCTGCAGCCC CGCCTCCGTT GTCAGATGTC TCCGTCTTTC 1560
CCCATCCACA CTGAGACGGA GCAGCAGCGT TTTAGAATGA AAACGGCCTC TCCAGCGTTT 1620
TCGAAACGCT CCGTTTTCGG CGCTCAAGAA CTCCGGCATA GTGTGGACGG ATGGCGTAAC 1680
CGTAGCAAAA CTTATGCGTT TTCAAACTAA AACGCATTAG TGTAAACGGG GCCTAATTCT 1740
CATTAGATTA TAAGTAGACT GTTAGATTGG GGTTAGTGTA AGCAATGTAC TTGCAAAGTT 1800
TCATATAGTC AGTTAAATGT CTTTTGAAGG AGCAGAATCA ACATATTAAG CAGACAGTCT 1860
ACTAATACTC AAATAAACCA TCCAAATAAA GTGTTACCCT GAAAAAAATA TCCATCTGAA 1920
TAGGGAAATT CACAGAATTT TTTTTTGATG AACTTTACTA CGGTAACACT TTATTTTTGA 1980
TGGTTTATGA GCTACACACT GAAA 2004