EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR002-02328 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_24hpf 
Coordinate
chr1:54892822-54894135 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Lhx3MA0135.1chr1:54894009-54894022CATTAATTAATTA-6.46
POU6F1MA0628.1chr1:54894010-54894020ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr1:54894010-54894020ATTAATTAAT-6.02
Enhancer Sequence
AATACCTCAG AAAACACTAC AATCACCATC TGGCGTCGTT AATTTCTTGC TTTAAAAAAA 60
GGCGCGCTTA AACCCTGTAC GTGCGAGTAC AACTAAAGTA ACGTTACTCG GTAAATTCCT 120
GTTAAATGAC ATGCACTATA AAGAAATACA CATACAACAA TCATTTAACG GACAAAAGTC 180
ATATTTTAAC ACTTACCGAG GATGAATCCG TTGGGTGAAG AGACGACGGC GTTGTCTGTG 240
GTGATGGCGC TTGTTTGCGG TCGAGTCGAG TCAGTTCTGT TCTATGAATC GGCTCCTTTA 300
AGTGAACAGT AAAGAGTCGA ATTCGGCTCC TTTAAGTGAA CAGTAAAGAG TCGAATTCGC 360
CTGAAAACGA GTCCGTTTTG TATAATATTG TAAGACGCAA ACATATAATT CATTAATATT 420
TCATCATATT GCTTGGTTCG TGTACTGCTT GTACACGAAT TGCTTGTTGA TGACTTCGAG 480
CTCATGAACA CGTCTGATAA AATATCTGAA TCTGATTCAA TGTCACACGA GTCCTGAACC 540
GAAGCAGTGC AAGAGTAATA TATTGATTGA AATATAAAGT TAATTATTTT CTTCGCCATT 600
CAAAATATTA CATATCTCTG ACTTTAACAA TAAGAATAAA GTTCGTTTGG AGTGTATTGA 660
GAATTATTAT TTTTTCCTCC CAGGATTCAT TTTGCACCAA GCTGCATCAA GCTGTAATGG 720
TGGATGAGAA GGCACATAAT ATTATAAATA TTGCTTGTAA TATGTAATGA AATAAAGTTT 780
TAACACTTTT TCATGCACTG TTAGTAAAGA TTGTGTGTAA TTTTAAGTGT GTTTTGCCGG 840
TAGCGGAGAT CTATGACCTC CAGGCGGTAA CGGCGCTCTT TACTCATGTA TCCGCCGAGA 900
GGCGCCTGTC TTCAGGCTAG ACATTGGGAC AATTGCCCCG TCTTCGATGG CTCTATATGC 960
GTCCGAAAAT GAAGTTTTAA CTGTTTTTCA TGCTAGAATG TGGTTGTTTA AAACTCTAAT 1020
CTGTGGTTTA TTTATATAAA AATAATAATT TATATATATA TATATATTTA ATTCTGAGAT 1080
TAGTGACCTC CAGGCGATGA CAGGTGCCCA ATACTCATGA AACCGTCTAA AGCAGACATT 1140
TACCCTGACA TTGAAATAAT TGTTGGCTGT TTAACAGTCT TTGGTTTCAT TAATTAATTA 1200
CTTTTTATTC CGGTTTATTA TGTTTTGGCT AAGCACACAG TTGTTCATTA AATATTATTT 1260
CATATTCTAT GTTAACTGTA TAAAATTAAA TAAAGGTGCA GTACAATCAA AAA 1313