EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR002-02298 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_24hpf 
Coordinate
chr1:54312491-54313339 
TF binding sites/motifs
Number: 11             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Nkx3-2MA0122.3chr1:54312527-54312540ACAACCACTTAAC+6.02
POU1F1MA0784.1chr1:54312694-54312708TTAATTTGCATATG-6.38
POU2F1MA0785.1chr1:54312696-54312708AATTTGCATATG-6.07
POU2F2MA0507.1chr1:54312694-54312707TTAATTTGCATAT+7.34
POU3F1MA0786.1chr1:54312695-54312707TAATTTGCATAT-6.74
POU3F2MA0787.1chr1:54312695-54312707TAATTTGCATAT-6.74
POU5F1MA1115.1chr1:54312696-54312707AATTTGCATAT-6.62
Pou2f3MA0627.1chr1:54313221-54313237TGGTATGCAAATGACC+6.37
Pou2f3MA0627.1chr1:54312693-54312709ATTAATTTGCATATGA-6.48
RREB1MA0073.1chr1:54313304-54313324TGTGTGTTGTTGTGTTGTGT-6.47
ZNF384MA1125.1chr1:54312581-54312593TTTTTTTTTAGT-6.32
Enhancer Sequence
ATTTGTTTGT TTAAATTCAA CACAAATAAA TTGTTTACAA CCACTTAACC TAAAAAAAAT 60
TGAGTAAATC CAAGGAATCA TCTCTAAATA TTTTTTTTTA GTGCAGCATT CTTCAATATA 120
TGTTGTCTTG TGTTCAACAA GAAGAGGATG AGTAAATGAT GCCGCGCTTT TCATTTTTGA 180
GTGAACTATC CCTTTATTTA CTATTAATTT GCATATGAAG AGTTGTGATT TGCTAGTGTC 240
TTGCTCTACT ACTAGAGATA CAGGAAATAC AACAGTGCAG CAGACCATGT TAGTGCACAC 300
GAATCCACAT CAGTAGACAA ACTGCTTAAA TAACACGTTC AATTATTTTT AAAGTGGCAT 360
TTTATGAGAG CACTGTGCTA ATAAACCTGC ATCTGGGCAT TAACACTGCA TCTAACAGCA 420
CTAAAGCAGA CACATGGAGG TGTCACCGCA TGCTTTTTTA GGGTGTCGTC TCACAATATA 480
GACTTTTTTA AATTCCCAGA GCCGCATGTC TGAACGTGTT TGCATGCTCT GTGCAAACGT 540
GGAGGATTAC AGGCATTTAT CTGCAAGCCT CTGGGGTTTA CAATCAGCTA AATTGCACTT 600
ACTTTTAATT TCATAAGAAT AAACTTAGTT AAAGTGACCA ACGTAATACA CCAATATAGA 660
GGCTGCTGCC ACTTTAAATG CACACTTGTA AATGAATTCC AATGTTTAAT GCAAGCCACA 720
CCACAATCCT TGGTATGCAA ATGACCCTCT AATAGCAGAA ATGCCAGTAA TTTCAGCATT 780
TTAACTGCTT TGGCCTGTTC TGTGAGTATG CTGTGTGTGT TGTTGTGTTG TGTTTATTTA 840
TACGAGCC 848