EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
DR002-02295 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_24hpf 
Coordinate
chr1:54088370-54089302 
TF binding sites/motifs
Number: 16             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
BHLHE41MA0636.1chr1:54089196-54089206GTCACGTGAC+6.02
BHLHE41MA0636.1chr1:54089227-54089237GTCACGTGAC+6.02
BHLHE41MA0636.1chr1:54089196-54089206GTCACGTGAC-6.02
BHLHE41MA0636.1chr1:54089227-54089237GTCACGTGAC-6.02
CTCFMA0139.1chr1:54088479-54088498CGGTGACACCTAGTGGTCA-6.85
ETV6MA0645.1chr1:54089277-54089287CACTTCCGCT-6.02
MITFMA0620.2chr1:54089192-54089210TTTAGTCACGTGACCAAG+6.97
MITFMA0620.2chr1:54089192-54089210TTTAGTCACGTGACCAAG-6.97
MITFMA0620.2chr1:54089223-54089241TTTAGTCACGTGACCTGG+7.35
MITFMA0620.2chr1:54089223-54089241TTTAGTCACGTGACCTGG-7.35
SPIBMA0081.2chr1:54089277-54089289CACTTCCGCTTC-6.44
USF1MA0093.2chr1:54089196-54089207GTCACGTGACC+6.14
USF1MA0093.2chr1:54089227-54089238GTCACGTGACC+6.14
USF2MA0526.2chr1:54089192-54089208TTTAGTCACGTGACCA+6.02
USF2MA0526.2chr1:54089194-54089210TAGTCACGTGACCAAG-6.65
USF2MA0526.2chr1:54089225-54089241TAGTCACGTGACCTGG-6.91
Enhancer Sequence
ATCCATCCCC CTGCCTTCCC TCTAGTGGTG GGCAAAGCGA GGCTTCGTGA AACACTGAAA 60
ATCGAAGCAA ATGAGTCGAA GTTTCGAAAC GTTTCAAAAT CCGACTCTAC GGTGACACCT 120
AGTGGTCATT TTTTCATGTA TTGCACCGAA ACAGCTTCAG CAAGAACATT TTAGCAAATT 180
GAGGTATTAA ACCCTACTGT GTAGAAGTAT ATATTCAAGA GTTTTAGTGG AGCAGTTAAG 240
GTTTCTGACT TTCATGTGTG GATAGTGGGT TTGAATCCAG GCTGATACAG CTATTTTGAA 300
ATGCTTTAAT ACCAGTTGGT AATTCTTTGT TCTTGTTTCG TTTTGTTTGA ACATGGTCTG 360
ACATCCGAAT AAACACTTTG TAAATAAATG TCTTGTTTTG GTATTAAAAC GGTTGTTGCT 420
AGATCAGACA CAGTTGTGGC CAGAAGGTAT CAAGAATTAG TTATATTATT CATTAAATTT 480
CCCATTTATT GTATTTCATT AACGTCTACC CAAACCCTAA ACCCAACCAT CAGTACTGTT 540
AAAATATTTA TTATTGTTTT AGTGTTACAA AAAGGATGCT ATATTAATGG CGTATCCGCA 600
GCTGTAATCT ATTTAGGCTG CACCATAAAA CAGAAATATG ATTAAAATAC ATAAAACCAT 660
GATTTGGCAG TATTTGTACA AGTCGAGGTT CGAACCCAAA AGACATTAAA GGAACTGTAA 720
AAGCGTACTC ACGCACAGTC CACTTGACCA TATGAGACGG CAGTATTGTT TAGATTCGCC 780
CGGTGTCAAA ACGCTTCTTA ACTGATCGAT GCTTTGAATC ACTTTAGTCA CGTGACCAAG 840
TGTTTCGAAA CACTTTAGTC ACGTGACCTG GGTGTTTCGG AACATGCTTC GGTGCATTGT 900
TTTGAAACAC TTCCGCTTCG GGATCTCGAA AT 932