EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR002-02218 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_24hpf 
Coordinate
chr1:52293464-52294594 
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Arid3bMA0601.1chr1:52293585-52293596ATATTAATTAT+6.02
HOXC13MA0907.1chr1:52293887-52293898GCTCGTAAAAA+6.62
IRF1MA0050.2chr1:52294496-52294517GTGGACTTTCTCTTTCAGTGT+6.08
Lhx3MA0135.1chr1:52293635-52293648AAATTAATTATAT+6
Enhancer Sequence
ATTATATTAT ATTATATTAA GTATATTTAT TATATTATAA TATATTATAT TATATTATAT 60
TTATTATATT ATATTAGGTA TATTTATTAT ATTATATTAA GTATATTTAT TATATTATAT 120
TATATTAATT ATATTTATTA TATTATATTA AGTATATTAT TATATTATAT TAAATTAATT 180
ATATTTATTA TATTATATTA TATTAAGTAT ATTTATTATA TTATATTATA TTATATTATA 240
TTATATTATA TTATATTATA TTATATTATA TTATATTATA TTATATTATA TATTTTTCAT 300
TTTCTTTTTC CAGGTGAAAC ATCATAAGCA CAGGTCTGAT ATGTATAAAG ATGTAAAGGT 360
CTTTGGCTGC TATTGCTGTC GCAGTGTTTG TTTTCCCGGA TCTCCCCCAA TGTGATCAGG 420
ATCGCTCGTA AAAAGCCGAA AGCGTTGCGT GCTGAACATC TCACTAAACT TTGTGCTTGC 480
GTCGAGTTTT ATCACTGGGA CTGGACGGTT AATAGGCAAT TAAGGTAAAC ATATAATTTT 540
ACACCTATTT GCAATCAAAA GCTGTGCAAT TACGAGACAG TAAAACCCCT TCAACCTGAA 600
AAATCCCCAA AACGGATGTC AAGGCGCAGA CGAGGCTCTC GGCCAACGGG AACACCTGAT 660
TAAAGACGAT GGTTCAGAAA AGCTGCGGAT AAAGGTTCCC CCGTCTCCGC CATAGTAATT 720
TTCTCATAAT TAACATTTTA GCAAGGTCAG TGCCTTCGTG AGCCACTTGA TTTAACAGCA 780
CTCGCGTTTT CAAAGTCTTT TAAAAGAGAG CTGAAACACT TCGGTCTTTT GTTGTCCAAG 840
TCAAAAGGTT GGGCTAGCCT AATAGAGCTA TTTCAGTAGA ACATAGATAT GAATGTCGAT 900
ATTTTAGTGT TGTGTTGGGT TTATGGATGT ATTGTCGATT CACATTATTA GATGCGCTTT 960
GGCGCGCTTT AATATGACGT GACAGACTTA AGTTAACGGC ACTACGGCAG GATTGACTGA 1020
CTGAGCGCCT CAGTGGACTT TCTCTTTCAG TGTGCTAGTT ATAAAGCACG AAATTAACAA 1080
AAGAAGATGG AAAAGGTATG TTAAAATAAG ATTTAAACTT ATTGAAATGT 1130