EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR002-01885 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_24hpf 
Coordinate
chr1:45584295-45585156 
TF binding sites/motifs
Number: 11             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
DMRT3MA0610.1chr1:45585013-45585024TTTGATACATT-6.02
IRF1MA0050.2chr1:45584517-45584538GTTTCCTTTCATTTTCCCTGC+6.05
IRF2MA0051.1chr1:45584516-45584534TGTTTCCTTTCATTTTCC-6.49
NR2C2MA0504.1chr1:45584882-45584897ACAGGTCAGAGGTCA+7.58
NR2F1MA0017.2chr1:45584888-45584901CAGAGGTCAAGGG+7.34
Nr2f6MA0677.1chr1:45584883-45584897CAGGTCAGAGGTCA+6.67
RXRBMA0855.1chr1:45584883-45584897CAGGTCAGAGGTCA+6.1
RXRGMA0856.1chr1:45584890-45584904GAGGTCAAGGGTTA+6.21
RXRGMA0856.1chr1:45584883-45584897CAGGTCAGAGGTCA+6.38
RxraMA0512.2chr1:45584890-45584904GAGGTCAAGGGTTA+6.03
RxraMA0512.2chr1:45584883-45584897CAGGTCAGAGGTCA+6.27
Enhancer Sequence
TTTGTTTCAA GTCAGTTTAA TTGATTACAT TTTGAATAAG TTTTAGGAAA TTTTGCATGT 60
AAAATGAATT GTGTTCAACT TAGAAAGCGA AGGCAGCAAC ACATTTTTTC ATGTGTGTTT 120
GTCTGAGCTG CACTACTGTC ACAAATTACT GGTATTATCG TAAATGACCA GTCATATGCT 180
TTGTTGATGC TGAAGACCAA ACATTTATGT CTGTTTTGTT ATGTTTCCTT TCATTTTCCC 240
TGCTGATGAA TGACTTTGTT CCACTAAAGT GTGTTAATGG CAGTTTTTAG AGGTGCGACT 300
GGTCCAACAG TGGAAACACA GCATGATTTT GGCCTTGCTG AATGACTGTT GGCCCCAATC 360
ACCCCAGAGT AAGCCCTGGG TTTGCACTGG TCTGACAGTG GAATAGCAGC TATTAATGAC 420
CCTGTTGTGT GTTGACGGAT TACGAACACA CACAGACACA CACACGCATG CAGAGAGAGA 480
GTTCACCTCC GGCTCAGTTT AAAAACTGAC ACTGCTGGAG GTCTGGGAGA GCATAAAGAT 540
GGTGGACTGT TCAGCAGTGA CACACTGCCG CTTTGTCTGC CGTCACCACA GGTCAGAGGT 600
CAAGGGTTAA ACACACAGGG TAAAGGGAAG GTCAAGGATC AGAGAGGCAG AGGAATGAAT 660
AAGAGAGGGT TTAGAAAGGT TGACAAGCCG ACTGATCCTC ACAGATTAAT AAAGCGCTTT 720
TGATACATTC AAGCTGTCTG GAGAAACAAG TGTTAGTGTT GGCTTAACTT CTGTTGTTGA 780
ATTACTTTAA GTAGACAAAA ATTACAAATA GTTTTTAATT TCTTGCTTGT ATAGATTTTT 840
AAAGTACTAA ATTATTGAAG A 861