EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR002-01687 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_24hpf 
Coordinate
chr1:41082945-41083947 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
IRF1MA0050.2chr1:41083909-41083930GAAGAGAAACTGAAAGAGACT-7.23
PAX9MA0781.1chr1:41083463-41083480CGTCAGGCATGATTGAA+6.19
RUNX3MA0684.1chr1:41083548-41083558TTTGCGGTTT-6.02
Enhancer Sequence
CTGAAACTAC CTAAACAAAG GGAACTCAGT AAAGTTGTTT TCAGAAAAGA ATGTATCTCC 60
ATGTATTAAA TACATTTCAG CAGTTCAGTA TTCAGTGTCA TTCCATTATT ACACAACTCT 120
AGACCTCATT TACCCTTGGC TGCATCAAGT TCTAGCAGTG CTGTGAGCTT CCTTGGTATG 180
ATTAAAGTAT GTTTATATAT TTTTCTTGAA GAAATAGGAA TTGTTCGAGT CTTCCTATTG 240
TAGTTTGGGT TTTGTATTGT CTCGTCGAGC TTGACTAGAC TTTAAGAGCC TGTCTGAACC 300
AGCCTGCCCA CTCAACACCG CAGCTTTGCA GAGTGTGACT GTCAGTCCAG TGCCAGACCC 360
TTTAAATAAA ACTATATACA GATACTCTTG GCTTGAACTC AAGGAATGAG GGCAGCCAAG 420
CAATGGACAG TCTACATTTA ACACTATTTT GATCTTGAGC AAGCGCGTGT GTCACAGAGA 480
AAGTGAGAGA GAAACACTGA TGGAAAATAA CTGGAATGCG TCAGGCATGA TTGAAGGGTC 540
TCTAGTGTAA GAAAGAATCT ATTTAAAGAA ACCAGTAAAT GTCACTCTAT GTTTAGCTTT 600
TGATTTGCGG TTTTACTTTT AAGATTTGTT TGAACTTTCC AGTTTTAGAA GTCCAGTTAA 660
CTTTAAAATA CATTCATCCT GGCTTTTTTT ATCGTCTGTT TAGCCGAATC CATTAGATTT 720
TCTGAAACAT ATGACAGCAC ATTCACTAAT GAAAAATAAT ACTGACTAGA CCATTATGAC 780
TCTCTGTACA AAGAAAAGTT ATAAGTGAAA GCCATGTATC AGAGATTAAT TATCAAGGGG 840
AAGGAGTAGG ACAAATATAA GAAATTGGAG ATTAACATAT AAGATATAAG ATTAACCTCT 900
ATTTTAAGTA AGCTTAACCT CTCAGCATGG AGAGAGAGAC CTGTAAAACA GGCAGCACAG 960
TCAAGAAGAG AAACTGAAAG AGACTATGGT GCAGGTAGTC CT 1002