EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR002-01685 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_24hpf 
Coordinate
chr1:41063520-41064132 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOXB1MA0845.1chr1:41063937-41063948ATATTTACATT-6.32
LMX1BMA0703.2chr1:41064093-41064104ATTTTAATTAA+6.62
SIX2MA1119.1chr1:41063717-41063733ACATCAGGTTTCAGGG-6.74
Enhancer Sequence
ACAATTGATT CCATAGTGTG TCCACCAGAG GCCAGTAGAG CACAGTAAAT GCGAGCAGAC 60
AATCAACGTG ACCTGCGGTC TTCTTCAGTT TGTGTATTGA TTTATTTAAT GGTTCATGTT 120
TATTATCCTT ACATTGTGTT TATTGTGTTT TATTATTCAC CCCAGGAGTG CGTTTAGTAG 180
AAAGTTGGGA TACAAATACA TCAGGTTTCA GGGGTAAATT TCCACAAAGA AACAGCTGTG 240
TCTTTATTAT TGTATGCGGT AAAGAGAAGT TCTTTCTCTC CTGACGGCTT ATCAGCAGAG 300
GGAAAGTTGT GTTTGAGAAA CACGTGCTAG CAGGCCAAAC TGGTGTTAGT GGGTCAGTAG 360
GCTGGAAGTA AACACACCAA GTGGCCCTTT GGACAGAACA TGACCTCGTT TAGTTAGATA 420
TTTACATTTT CTAAATAAAA TGTGAAAGAA AACTTGGGGT GGTTAATAGT TAATCTATTT 480
TAAATATTTT CTAACTGCCT TCTTAAATGT ATAGGCTACA AAATAACTAT ATAGAGAATT 540
ATAGTGTGTG TGTGTGTGTG TGTGTAATTA AACATTTTAA TTAAGCTATT TAAATTAGTT 600
TATTGTGATT GC 612