EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
DR002-01571 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_24hpf 
Coordinate
chr1:39349158-39351030 
TF binding sites/motifs
Number: 12             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CTCFMA0139.1chr1:39349798-39349817CTCCTCCCCCTGGTGGGCA-6.02
HOXA10MA0899.1chr1:39349647-39349658TTTTTATTGCC-6.32
RFX1MA0509.2chr1:39349768-39349784TGTTACCATGGAAACA+6.66
RFX1MA0509.2chr1:39349768-39349784TGTTACCATGGAAACA-6.67
RFX2MA0600.2chr1:39349768-39349784TGTTACCATGGAAACA-6.82
RFX2MA0600.2chr1:39349768-39349784TGTTACCATGGAAACA+6.85
RFX3MA0798.1chr1:39349768-39349784TGTTACCATGGAAACA-6.89
RFX3MA0798.1chr1:39349768-39349784TGTTACCATGGAAACA+7.02
RFX4MA0799.1chr1:39349768-39349784TGTTACCATGGAAACA+6.42
RFX4MA0799.1chr1:39349768-39349784TGTTACCATGGAAACA-6.68
RFX5MA0510.2chr1:39349768-39349784TGTTACCATGGAAACA+6.75
RFX5MA0510.2chr1:39349768-39349784TGTTACCATGGAAACA-6.79
Enhancer Sequence
GTAATCCCCC ACCTTCATGT ACACACAAGA GTATCTCTCA ACAACACAAC AAACACAATT 60
ACTCGCTATC TTCTCCTAGC ATGCGCGAAC ACACACACAG ACACACACAC ATATATATAC 120
ACTCACAGAT GTGCAGTATC TCTATTCAGA CCACACACAC ACACTCAGTC ACTCACCAAA 180
GCTGAGCAGA TTGTGTTTCA TAGTATGGTC CATCAGCAGC AGGAACTTTG TGTTTGTCCT 240
CATGACCATC ACCTGAAACA CATTAACAGT GCTTCAAATT ATAGATCTTT ACATACTCAT 300
GCTGTTGCTA AAACATATTT TGCGTGCTCC AACATCTTCT GTCATGTTGT TAGCTTGGTT 360
GAGTTATGAA ACAGTGATCA AGCCGTAGAA AACAGGCATT CCTATTTTGG CTATAGTTTC 420
ATGATCATAA CATATCCAAC TAAATTAAAG CATTCTGGGA AATGAAGTGT TCTTTCAACA 480
TGGCCCACTT TTTTATTGCC TTTTAAAATT AAGAAGTCAT TTTGGTTTAG TTTTTATCAT 540
TTAATTTAGG TAATTATTCA AAATTTGCTC AAAATTCATC CTGTGCAAAC CATTTAGGAA 600
CTAGATACAG TGTTACCATG GAAACAGTAT GTTAAGCAGA CTCCTCCCCC TGGTGGGCAG 660
TCCCATGTTT CATTTGCAGT CACATTGTTA GTTTGGTCTC TTTATTGTTG CCATTGTGAA 720
TGCCACATTA CGCCTGTTTC ACACCGCAAG CACAAGCATT GCGTGCGCAG CGCGTATGGA 780
GAGCAGAAGC AGCGCGCAGG CATTTGCCTT TTACCGACTG CGTCTGCAGC GCACAGCTCA 840
TCGGCAGCTG CTGCACAGAT CAATCTATCT TGTTCTTTTC TATCTAGTTA CCTATCGATC 900
GATAAATACA AATTTTAAAA ACTTTTCATC TGCACCAAGG CCCTCCTATG CTGTTGCCTT 960
AACCCACGAG TCTTTATTTG ACAAATTATA TAGATCATAC AGTACTGTAT GCTTCTCAAT 1020
CTCTATGAGG AGTGTCATTT ATGTCTTTCA GGTGCTCTCG GCCAAGACAA TCGCCTGTGA 1080
TATCATGTCA TTTTGTTTTT GATTGTCAGG ATAATGTAGG CCTATAGTTA TAATAATATT 1140
TATACAATAT AGTTATAATG ATATTTATAC ATGATCAAAC TCAACTGTGC AACTTACTAA 1200
GCAAAAATAA TTCTGACGTT GTTTTAAATT TGGTTTTGTA GTTCAGGCCC AAATAAATAT 1260
TTGTTGCAAT TGTTTAAGTT CATTTGATTG ATTATATAAA ATCAGTTGAT ATTATCGATG 1320
CATTTATTGG GTAAAATTAC TACCTTTTAC TGTCATTCAA TGTGTCTTTG GTCATTATCA 1380
ATGGACTGTC CCTTTAATTG AGCGTGAGCC AGCACCAAAA CTATTGTGGC ACTGCTGCTT 1440
TAACGACGCT CATGCCTCGC GCTGACCTGT ACTGTTTTCG TGGCAAAGAC AAAAGGAATT 1500
AATTATTAGA AATTAGTTAA TAAAACTATA ATAGTTAGTG ATGGTGAAAT GAAGCTTTCT 1560
GAACTATTGA AGCGTTCGAA GCGTTCTAAA AAAAAGTTTG TTACTCGAAA GTTTCCAAAT 1620
CAGAGCTTGA TGACAACCTC TGATGGTTAA AGTGTGGGAA AGTGTTGTGT TCAAAAATAT 1680
CAAACATTTA AAACTGACCA ACTTATTAAT GTAGTAATAC AACAATACTA ATATAAACAA 1740
ATTACTCAAT TACTGTAGTT TTTTGCAGTA AATGTACGCT ACATTACAGC ACAGATGACT 1800
GTAGTAAAAT CCAAGGTATT CAAAAGTGTT TACATTTATC GTATTCCAAC TGGTCCAACA 1860
TCCACCCACT TG 1872