EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR002-00804 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_24hpf 
Coordinate
chr1:19387540-19388843 
TF binding sites/motifs
Number: 12             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
HOXA13MA0650.2chr1:19388601-19388612ACCAATAAAAC+6.32
HOXB13MA0901.2chr1:19388601-19388612ACCAATAAAAC+6.32
IRF1MA0050.2chr1:19387995-19388016ATGGAAAAAGTGAAACTAAGA-6.79
NR2C2MA0504.1chr1:19388319-19388334AAAGGTCAGAGGTCA+7.82
NR2F2MA1111.1chr1:19388318-19388329CAAAGGTCAGA+6.14
Nr2f6MA0677.1chr1:19388320-19388334AAGGTCAGAGGTCA+7.28
RXRBMA0855.1chr1:19388320-19388334AAGGTCAGAGGTCA+6.55
RXRGMA0856.1chr1:19388320-19388334AAGGTCAGAGGTCA+6.58
RxraMA0512.2chr1:19388320-19388334AAGGTCAGAGGTCA+6.62
ZNF384MA1125.1chr1:19387560-19387572TTTTTTTTTTTT-6.22
ZNF384MA1125.1chr1:19387561-19387573TTTTTTTTTTTA-6.37
ZNF384MA1125.1chr1:19388807-19388819TTTTTTTTTATT-6.62
Enhancer Sequence
TTCTGGAAAA AGAAGTTCTG TTTTTTTTTT TTACCAGGAT AAAAGCAGTT TTTATTATTT 60
AAACACCATT TTAAGGACAA AATTATTAGC CCCTAGGCAA TTTTTTATTT GATAATCTAC 120
AGAACAAACC ATCCTTATCC AATAACTTGC CTAATTACAC TATCCTGCCC AGTTAGCCTA 180
ATTAACCTAG TTAAGCATTT AAATGTCACT TTAAGCTGTA TAGAAGTGTC TTGAAAAGTA 240
TCTAGTCAAA TATCATTTAC TCTCATCATA GCAAAGACAA AAGAAATCAG TTATTAGAAA 300
TGAGTTATTA AAACTATTAT GCTTAGAAAT GTGCTAAAAA ATCTGCTCTC TGTTAAACAG 360
AAAAAATAAA CAGGGGGCTA ATAATTAAGG TGGGCTAATA ATTCTGACGT AAACTGTACG 420
TATGTATAAT TAATAATAAT TACTACAGTA ATTATATGGA AAAAGTGAAA CTAAGACATA 480
CCCTAACCCT AACTCTTAAA GTAAAGTTTT ACCCAAACAA GACATATGAT GTTTTGCTGA 540
AATAAATATA ATATGGCCAT CACAGCATGG GATGTGCAAA GAGACATATG TAAAAGACAC 600
CACTAGCGGT TGTAGTCAGA TTTTGAAGCC ACATGTCATT GGTGCCACAA CTGGGCCTAT 660
GAAAGTGATA ATCACTGTGT TCTGATGACC ATATGCTGCC CGTTCATTTG TTACCTAACC 720
ACAAAACAAC CTTTGTAAGG TTGTGCATGG AATCCTTTGG TATTTGACCC TAGTAAGCCA 780
AAGGTCAGAG GTCAGTCTTT CACCTATACA ACTTGGCATA TGCTTAGTGA GTTGTCTATC 840
GGAAAAGGCG TTTGAAAAGA TCACAGATTT CCCTGGATAC TTCTAATCTC TGTCTTGAAC 900
ACACCCATAT GGTTTGTGTG TATCACGTTG ACACACATGC CTATTTGAGA GTGTTTGTCT 960
GAGGTCATTA TCGAGCGTGC TCAGACAGAG GTGACCGCAG GGTCTCAAAG ATCAGATGAC 1020
ACAATAGTGA CAGTTATAAG TCTGACAAAA AGTATTATTT TACCAATAAA ACACAAGCGG 1080
ATGCATACGC ATGTGCAGAG TTGTCATCAG TTGACCTCAG TTGCTTAGCC ATTTGTCAAG 1140
TCTGAATAAT TCATTGGGTG TCTCTGCTTT ACTAGATGAA TTGATCTGAA TTATTTAAAA 1200
GCTAGAGAGA CAGATTGACT CCATGCACTT TGATTTATGT TTGCTATCTT TCTGTTTGCC 1260
ACAAGCATTT TTTTTTATTC ATACCCAACT AATGTAGTAA AAG 1303