EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
DR002-00208 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_24hpf 
Coordinate
chr1:4630605-4631987 
TF binding sites/motifs
Number: 10             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Alx1MA0854.1chr1:4631515-4631532TGAATTAATTAATCATT+7.39
HNF4A(var.2)MA1494.1chr1:4631064-4631079TTGACCTTTTGACCT-6.35
Lhx3MA0135.1chr1:4631516-4631529GAATTAATTAATC+6.54
Nr2f6(var.2)MA0728.1chr1:4631065-4631080TGACCTTTTGACCTC-9.03
POU6F1MA0628.1chr1:4631518-4631528ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr1:4631518-4631528ATTAATTAAT-6.02
RARAMA0729.1chr1:4631062-4631080TGTTGACCTTTTGACCTC-7.24
RarbMA0857.1chr1:4631065-4631081TGACCTTTTGACCTCA-8.59
RargMA0859.1chr1:4631064-4631080TTGACCTTTTGACCTC-9.33
SOX13MA1120.1chr1:4630822-4630833GGCCATTGTTT-6.02
Enhancer Sequence
GACAATAAAA CAACAAAATC TGATGCTTTG CAAGGAATCT TGAGTTTATT TCAACATATA 60
TGCTGCAGTC TGTTTCCCTG CCATCAATCT CACTGGAAGC AATTCATCTG AAGGATACGC 120
TGCTTTATCT GGACCCTGTT ATAAAACTGA TAACTCTTCA GCCTGTTTTA GGGCATTTCC 180
TTTGTCTATT GTCTCCTTCT CGCGTAGCCC AAGGGAAGGC CATTGTTTAG TTGAATGCAA 240
GAAAGAAAAA TCCTGCCGTT AACCTTATTC CAACCCCACT GTGATGAGCA CTTTAAGGTC 300
ACCGCTGGTG TGTAACTAAC CTTTGAGCTA AACAGGCAGA TTTTTATCAA AAACAACTTG 360
TGACCGACGT CTTGGTAAAA TAACTTCCAT TGATCACCTG ATAAGCATGT GCTTGTGTTT 420
CCAAATTAGA CACTACAAGC TTTTCTTCAT TAAGGGCTGT TGACCTTTTG ACCTCAGCTG 480
TACAAATGCT GATGCCTTTC TCACCAGAAG CACATGTTGG ACCAGAGGCC ATCCTTGAAG 540
CCACACTCCA CTTTAAAACA AAATAGGCTC AGTTTATAAC TCCCCTGTAG TTGAACAGTT 600
GAGTTGTATC ATGTTGAATT CATTCACACA CTTTTAGCTT AGCTTAGCAT AAATCATTGA 660
ATCGAATTAG ACCATTAGCA TCACTCTCAA AAATGACCAG AGAGTTTCGA TACTTTTCCT 720
ACTTAAAGCT TAGGGCGTAC TCAACACTAT GCAATCCGAA CCATGCCCAG GCCCGTTTCC 780
TGGATCGTTT GAGAAGTGTG AGTGCTCTAA ATCGAGCAAA GTGAGTGCAG TTCACTTGGG 840
CTTTGGTGCG GTACGCTTGT GTGTGAGTGC AAAACGCCTC TAAGCCCGAA ACTGAAGGGA 900
CCTTTTCATA TGAATTAATT AATCATTCTC ACTGTTTAAT GAATGCAAAC TGTCGTAATT 960
TATTAAAGAC GCAAACCCCT CACTGCACAA CAGCTGCACC TTCAGCAAAC CTTCTCATTC 1020
CTGCAGCACG AGGACTTTAT GATTGTTTAT GAGCGTTAAA AGTGGCTGAT CTGTTCGGTG 1080
AAATATCTGA CTGCGTGTCA CTACATATCA AACGACTTAA ACAATATAAC AGTAAGAAAT 1140
CTCCACTGTG CTGAGCAAAA GCGCTTACTT AACAGCGCAT CATCGATGAC AGAAGCGTGC 1200
CCAGGAGACA GGACAGGGGA TAAGCGTGCT TTGGCCCGGA TCAAGGCAAC TGTACATAGT 1260
GTGAGTACGC CCTTAGTTAC ACTGTGTACA TGGCTGATGC AAAATGAAAG TTTGGTAAAT 1320
GGTAAGCTAT TTTCTAGGCA GATATGACTA GGAACTACCC ACATAGCTAA ATTTCTCTTG 1380
CC 1382