EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR002-00171 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_24hpf 
Coordinate
chr1:4388286-4389470 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Nkx3-2MA0122.3chr1:4388619-4388632TTTAAGTGGTTAA-7.12
RELMA0101.1chr1:4388595-4388605GGAAATCCCC-6.02
ZNF384MA1125.1chr1:4388393-4388405TATAAAAAAAAA+6.92
Enhancer Sequence
CCTTTTTCTT TTTTCCTATG ATTACAGACA TGCGCAGGAA CCACCAAAAT TAATTACAAT 60
ACGCTAGACC ACACAGAACC TAAAAGGTAC ACTTTCAAAT TTGAGTTTAT AAAAAAAAAT 120
ACAAAAAGCT CCTCTTTTTT TAGGTGTTTA TTATAACACA GACAACATAT ACAGTTATTT 180
TAAACACTTT CAATAGTGTT TTATGAAAAT TCAAAGGGTT TTCTTTAAAA TGATACCAAA 240
TTTTTTTGCA TTTACACCTC TTTATGTGGA TTTGGGAAGC TTTTAAATTT GGGTAGGCAA 300
AATCCAGGCG GAAATCCCCA AATAGCAGCA GAGTTTAAGT GGTTAAGGAA AAACTCACTT 360
AATTTTGACT TATTATTTCT GAAAACAAGA CACTTTTTTT TGATTGTCTG GAAAATTCTT 420
CATGATTTAA GAGTTTGTGT ATATCGGGAC TAAAATCAGA CAAAGAATCC AAAGTGTTTT 480
TGTTGTATAG TCTTAACAAC TATTATTAAG CATCAAATTA AGAGCTAAAA GTCTCAGTCA 540
GTGGTCTTTT AATAGCAAGA ATCGTACCTT AAAATAAATG TTACCCTCTT ATTACACCCC 600
AGATTGATAA TAAGCCTGTC ATTTCACACA CTAGCACATA AACACCTTTG TCTCTGATTT 660
AATGAAGTTT TCTTCACTGC GTGGGTTGTT CCTCACCTCT CGCTCCACAC TTTGGCATTC 720
AGTCCGGCTT CCCTGCGCGT CGTGTCAGAA AGAGGCAGTG CATCTTTCAC AATGAAGGCC 780
ACAGTGTGTG CGTGCGTTTC CGGTTACTTG GCGTGGGAGG CATGGCTCGT AAAGGACATG 840
GGATGTTGAT GAAACGAGCT GTGATCTGCA GGAACCCCTA CGGTGGTTTC GTGTCGCCAC 900
GAGCAAAGAA ACAGCATCCA AACTGCTGCT TATTTATGTA CGAGCAGAGC ATCTACAGTC 960
ATCCATACAT GTAGCTTTGC ATCTGTTGCT CGCCACCTAC AGAGAGACAG ATGTTTTTCT 1020
CTTTTTTTTT CGTCTCCACT TTCGGTCTAG CTTCCCTCCC ACTGCTTCTG TCTTTCATTC 1080
TCAGTCTTTC ATGCCTTTCC ATGTCTGTTG TTTGTGTTTG CCTGTCATTT TAAGATGGAT 1140
ATCTTCATTC TCTTTCAGTT CTAGTCTTGA TGTGCGTCTC GCGT 1184