EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR002-00053 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_24hpf 
Coordinate
chr1:904105-905213 
TF binding sites/motifs
Number: 9             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
NFYAMA0060.3chr1:905138-905149TCTGATTGGTC-6.14
NFYBMA0502.1chr1:905139-905154CTGATTGGTCCGTTG-7.19
NR2C2MA0504.1chr1:904923-904938CAGGGTCAAAGGTTA+6.26
Nr2f6MA0677.1chr1:904924-904938AGGGTCAAAGGTTA+6.88
RXRBMA0855.1chr1:904924-904938AGGGTCAAAGGTTA+6.93
RXRGMA0856.1chr1:904924-904938AGGGTCAAAGGTTA+6.93
RxraMA0512.2chr1:904924-904938AGGGTCAAAGGTTA+6.95
ZNF24MA1124.1chr1:904730-904743GAATGAATGAAGA-6.24
ZNF24MA1124.1chr1:904726-904739AAATGAATGAATG-7.34
Enhancer Sequence
GCAGGTGTCC ACCCAGCGGA GGCTTTTAAC AGAGAGAAGA GCTGCAGATC CACAGCTGTT 60
CAGAGAAACG CTCACCTGTA ATCAGGACTC ATCCAGCTGT TTCTGCAGGT GAGAGCGGCT 120
CCTTCATCAT AATCATCGCT TGCGCACATT CACACAAAAA CACACACCAA CACACACTGA 180
ATGGACAGCT CTCAGCATTC ATTTCTCACT CAGAAAAGCC TTCGAAACAC TTTATACATT 240
GCAAAAATGC CTTTCTTGCA TTGAGTTTTT GTCTTGTTTC AAGTCCAAAT GTCTAAAAAC 300
TCTAAAATCA AGAAGCATTT TCTGGAGGAG CAGAACATAT TGTGTTGTTT TCAGAAATAT 360
TGAGTTAAAA TTAAGTGAGT TTTGCCTTAA AACAAGCAAA ATAATGGGAA TAATTCCCCC 420
ACAGTTCAAA CACATGTGGT ATAGGGGAAT TAATCAACTA AACTGGCTGT AGTGTGTAAG 480
TGTGTGTGTG TGTGTGAATG GGTGTTTCCC AGTACTGAGT TGTGGCTGGA AGGGCATCCA 540
CTGCGTAAAA AATATGCTGG AATAGTTGGC GGTTCATTCC GCTGTGGCGA TCCCTGATAA 600
ATAAGTGACT AAGCCGAGAG AAAATGAATG AATGAAGAAT ATAAAACTGT TAAGTTATTG 660
AACAGACCTC ATCTCTGCTC ATCATGAGAC TGAGATCCTA AAAATGCTGT CATGGCCCAA 720
ACGGATGATT AGGATAATGT GGTCCAGGTT GTTTTTAATG AAGAGAATGC AAAAGCAGAC 780
ATTCCTGCAG GGTTGGGGTT GGGGTTAAGT GCAGAGGTCA GGGTCAAAGG TTAAGACAGG 840
TTCAGGACTG ACGTCAGAGC TGCAGTCGTC TGACGGAGGA ATGAAATCAA ATCTGTCCTG 900
ATGTTCACTC TCCCAGAAGT GATGCTGAAG AGAGCGTCGA CTGCGCATGG ATAACGTCAG 960
TGTCAAGATA TCAGAGCATT TGCTCCAGAA AGGCAGAAAA TCACTGCTTA TAACACGGCT 1020
GTCTGGACTA GACTCTGATT GGTCCGTTGT GACATTCAGA AGGATGTTAT TCCCAGATAA 1080
CAACCGTGAA ATCACAGAGT TATACGGG 1108