EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-37389 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr9:56291910-56293384 
TF binding sites/motifs
Number: 25             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOXB1MA0845.1chr9:56292088-56292099ATATTTACATT-6.32
PHOX2AMA0713.1chr9:56292100-56292111TAATTTAATTA+6.62
PROP1MA0715.1chr9:56292100-56292111TAATTTAATTA-6.32
PROP1MA0715.1chr9:56292100-56292111TAATTTAATTA+6.62
Phox2bMA0681.1chr9:56292100-56292111TAATTTAATTA+6.62
RFX1MA0509.2chr9:56293010-56293026AGTTGCTATGGTAACA+6.54
RFX1MA0509.2chr9:56293064-56293080AGTTGCTATGGTAACA+6.54
RFX1MA0509.2chr9:56293010-56293026AGTTGCTATGGTAACA-6.55
RFX1MA0509.2chr9:56293064-56293080AGTTGCTATGGTAACA-6.55
RFX2MA0600.2chr9:56293010-56293026AGTTGCTATGGTAACA-6.82
RFX2MA0600.2chr9:56293064-56293080AGTTGCTATGGTAACA-6.82
RFX2MA0600.2chr9:56293010-56293026AGTTGCTATGGTAACA+6.86
RFX2MA0600.2chr9:56293064-56293080AGTTGCTATGGTAACA+6.86
RFX3MA0798.1chr9:56293010-56293026AGTTGCTATGGTAACA-6.48
RFX3MA0798.1chr9:56293064-56293080AGTTGCTATGGTAACA-6.48
RFX3MA0798.1chr9:56293010-56293026AGTTGCTATGGTAACA+6.73
RFX3MA0798.1chr9:56293064-56293080AGTTGCTATGGTAACA+6.73
RFX4MA0799.1chr9:56293010-56293026AGTTGCTATGGTAACA-6.28
RFX4MA0799.1chr9:56293064-56293080AGTTGCTATGGTAACA-6.28
RFX4MA0799.1chr9:56293010-56293026AGTTGCTATGGTAACA+6.69
RFX4MA0799.1chr9:56293064-56293080AGTTGCTATGGTAACA+6.69
RFX5MA0510.2chr9:56293010-56293026AGTTGCTATGGTAACA-7.13
RFX5MA0510.2chr9:56293064-56293080AGTTGCTATGGTAACA-7.13
RFX5MA0510.2chr9:56293010-56293026AGTTGCTATGGTAACA+7.14
RFX5MA0510.2chr9:56293064-56293080AGTTGCTATGGTAACA+7.14
Enhancer Sequence
TGACGTGACA TTAGAATAAA ACTACCCAGT ATTTCTTATA GATTCAATTT ATAATACACA 60
GTCGGTCATA ATAGATTATA ATAGCCCTTT TGTTTCCAGC ATGTGAGCTG CACTCTAAAG 120
GAACACCGGG TTGATTTAAC CCAACTTTGA TGAACAAAAA CTCGATATCG TTCGGTTTAT 180
ATTTACATTT TAATTTAATT ATCACTTTTT AACTCAAGCG TTGAATTGTC CATATTTGAC 240
CCAACACTGT GTTAAAACAG CCCAGCGTTT TACAAGCACA CATGCTTATA TTTTCATTTG 300
TCTCAACATT TGTCTCGTAT GTTCGATGAT GAAGCAAAGT CTTACCTTGC GTTCTGACTC 360
CAGTCATTAG TAAACTTCCC AAAAGCAGAA TCCACAAGTG TGACATCATT GTGTCCTGAA 420
TGGAGCTGAG CTGAACAAGT TCGAAATCAC GACCTACTTT AATGTACTTT TCTGTCTTTC 480
TTTTCTTTTT TAAAGTGACG GCTTTGAGCA CGCGTGGATG TGTGTGTGTG TTTCTCTGTG 540
TGTGTGTGTG TATGTGTGTT CGCACGCATG CATGCAGTAG TGTGCAGTCT TTTGTTGTCC 600
AGCTCTTCTG GATCCCGGGC TTCAGCGCCG CCCACAATCA GACGGAGATC CAGAGGCAGA 660
AACTCGCAGG ATGCGTGAGC GCACAGAAAA TAACCATACA CTGCTAAAAC ACACACACAC 720
ACACACACAC ACACACACAC ACACACACAC ATGCATGCGG GCTTCCCTCA TTCTGATCAG 780
ACCCAATGTT CTGACGTTTT ATCCTGCCCG TCAGATTATG CTACCAACAC TATTTGAATG 840
GTTATGATGT GGGTTAGGGC GACATTAAAG CCTCCGGTAC ACAATGTAAC AGCACATTTC 900
ACCATCAAAA TGCCTATAGT TTTAATGGGA GGTCGGAAAA TCTGACAGGG TAGGACACCA 960
GCATAAGACC GTCTAAAGTT CTTGTTTACC CCTTGATACA ACATTGATAC AACGTTCAGT 1020
GTTATCACAA ATGAAAAAGT ACAATAGCAA TTCACATACT ATAGGAAAGT ACTTGCATTA 1080
ATCTGCTGTG GTTATTTTAT AGTTGCTATG GTAACAAAGA AATAATCTTA TGTGATCTAT 1140
TGGTGTGATT CTGTAGTTGC TATGGTAACA CAACAACTGT AGTAATATAA ACAAAATGCC 1200
TATACTAAAT GGGTATATTA TGTACTACAA TACAGTTTAC TGTAGTAAAT ATTAAAGTAT 1260
ACTGCACTAT GATAAGTTTG TCTGTCGACT ATAGCTGTAG CGTGAGTTGT AAATACTGCA 1320
ATGAATACAT ATATTTCTTA TAACACACTA CTCTATGGTA TGGTTCAAAA GTACTATAAT 1380
CTTTACTATA TTGTTTAATG CATATCGCTG AAAACATTCC ACCTTTAAAA ATCACTAAAG 1440
CAATTTACAG TAAGAGTGCT TCCCAACCAT GAAA 1474