EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-37266 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr9:53011878-53013199 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOXA1MA0148.4chr9:53012393-53012409CACAAAGTAAATAAAC+6.4
NKX2-3MA0672.1chr9:53013023-53013033TTCAAGTGGT-6.02
Nkx3-2MA0122.3chr9:53012067-53012080AAAACCACTTAAA+7.52
Enhancer Sequence
CTTTATTATT TTTTGGATTT GATTATGTGA ATGTGTATTG GTTTATGTTT ATTTTATAAA 60
TCTCAATCAA ATCTATAAAA AATGACTTCC GGTTATGGCG TGCAGCTGAT AAGACGCGTG 120
AATCGGGCTC GCTACTGAAT GTTCGTTTAA ATTTCCAAAA AGGCTAGAAC TCGTATAATA 180
AGCGTTTGGA AAACCACTTA AAAGTTCGAC GGACAAAAAT GCCACCCAAA ACCATCAAAC 240
TTCCACAACA TTCTAAGCCA TCTGGACAGA TGGAAGAGGA AGGCAAGGTG TTAGCTAGCA 300
AGAAGCTAAC CGAGCCACAA AGTGAAGACA ACGCGGCCAC AAACGACGAT ATCCTACGTG 360
CAGTTCAATC CTTTAGAGAC GATTGTTCAA AACAATTCAC TGACACAATG GAAGCCATAA 420
ACGGCATAAA AACGGACTTA CTGTCACAAG CGCAACGAAT TGGAGCGGCT GAGGAGAGGA 480
TCTCACAGGC TGAAGAGGAC GTAACAGCCC TTCAACACAA AGTAAATAAA CTCGAAGAAA 540
CAACTGAATT TCTACGAAAC AAGGTGCAGG ATTTGGAGGA CAGAGGAAGG CGTTCTAACC 600
TGAGACTAAT TGGCCTGCCA GAAAAAACAG AAGGGTCCAA TATGTGCGCC TTCATTGAGA 660
ATTTTTTCCC TACGATTTTG AGGGATGAGT TCGGATCGCC ACCTGCCATT GAACGAGCGC 720
ACCGCGTAGG ACAAGTTAAC CCGAACCGCC CGTCAGCTCC AAGAGCGATC GTGATAAAGT 780
TCCTGAATTA CCAGGACAAG GAGAAGGCTT TAAGAGCGGC TAGGAAAATG AAGGAGTTAA 840
GATACGAAGG GCAACGAATC AGCTTGTTTC AAGATTTATC AGCAGAGACT CGTCAGAGAC 900
AGCGACAGTT CGACGGAGTA AAAGCACAAC TTCGAGGCAT GGAAATTCGG TATGGGATGC 960
TTTACCCGGC GCACCTGATA GTCACGCACG TCGGCCAGCG TCATGTCTTT AAAACCGTAG 1020
CGGAGGCAGA GGATTTTGTT CGGTCAGTAC GAACCAATAT TTAAACTTTG CGACACAAGT 1080
AAGCGCTGAC TCATCAGGAC TTGAACACTG TGTCTAGTTA ATAAGGATAC ATTTTTTCAT 1140
TCCTTTTCAA GTGGTTAAGA TGTTTACATT TACGTGGAAT TAAACGTGAT TATTTTCTAC 1200
CAGAACTGGT AAATATCGGC AAATTACATT ACCAGTTATG TAGTTTAAAT AGATTTTTCC 1260
GTTCTCTACT ATGTTCACCA GTATGAGTAA ACAAGTTCAT GTATAGAGGC ATACGAGTCA 1320
G 1321