EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-36975 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr9:38059946-38061084 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Foxd3MA0041.1chr9:38060423-38060435AAATGTTTGTTT+6.27
ZNF384MA1125.1chr9:38060317-38060329TTTTTTTTTTAT-6.27
mix-aMA0621.1chr9:38059993-38060004ACTAATTAATT-6.62
Enhancer Sequence
TGAACCACAT AAAACTAATT TTAAAAAATG TAAACTCAAA TAACGTTACT AATTAATTAA 60
AGAATAGTTT AGGTTAACGT TACATAGAAA AAAAACATGA AGGCGTATTT CAGTTTCGTC 120
GAAAACACTA ACGTTATAAT CAAAGTAATT TCAAAATTAG TTTAATATTA TAATAGTTTA 180
TTTGGACGTA AAAAAAACAG CATTGAGTTT TGACATAAGC AAGGATAACC CGGTGAAGCT 240
CCACTGAAAT ATTAAATGTC TGTATAATCA GTAGGACAGA AAACGTGTGG TATTTGCTTG 300
ACGTCTTACC TCCGTGCTTT CGTTTGGATT ACAAACACAA AGAAAGTGAA CTAAAGTTGA 360
AGTGTGTAAT GTTTTTTTTT TATGTTAAAA TACGTTCTTC TTCTTCTTAA ACGTGTAGAG 420
AGACATACAA GCCGCCAATT TCATCTTATA TCCTGCTTGT GTCGCTGTTA AAACCAAAAA 480
TGTTTGTTTG AGTTGAAAAT CTCGACCAAC ACAAGATAAC ACTGGCCTAA CCAATGGCGT 540
GAGTTTGGGG GAGGGATGAA ATTAATGTGT GACCAATGGT GGAAAGGGAG CGTGTGTTGT 600
GGCGCTAAAA CTACACACTT CACCTTTAGC GTATAGCAAA AGCAGCACAT GACTGTCATC 660
TAGCACTAAA AGCTCGTATT ATCATTATGA TGACTAAAAA TACAAAAACA TTCAACCAGA 720
TATTTTATTT TTAAAATTGC TGGCAAGAAA ATGGCACTGA TTAGGAAAAT AAAGACTGAA 780
ATGATTCTGG AAGCCCTGAT GAGTCCAAGT TTAAGACTGT AGAACAGGAC CAAATATACT 840
TTATCTTTTT ATAACACCTC TGAGGAAGGA AATGTAGATT TTTCCCCCCA ACACATTACA 900
TCATAGCCAT ATCTGGATGT ATACTGAAGA TCTGAAACAG TTAAAGCAAA AAGAAAAACA 960
AAAACCATGT CACTTTATGG AGAACTCTAT ACATTTTGTG TACAAGCTCT GATTCTTTAC 1020
ATACAAAGGC CTCATTGGAG AAAACGGACA TTCATTGGGT CGTACCATCA AACTGAGAGG 1080
GAAGGGATTG CTGGTCGAGC TGCAGTGCAA AAAATGGTGA AGATTAGTGG ATAACAGA 1138