EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-36930 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr9:35003167-35004085 
TF binding sites/motifs
Number: 17             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
DUX4MA0468.1chr9:35003725-35003736TGATTAAATTA-6.62
DUXAMA0884.1chr9:35003724-35003737GTGATTAAATTAA-6.28
Lhx3MA0135.1chr9:35003877-35003890TAATTAATTATTA+6.18
Lhx3MA0135.1chr9:35003873-35003886TAATTAATTAATT+6.78
Lhx3MA0135.1chr9:35003874-35003887AATTAATTAATTA-6.78
Lhx3MA0135.1chr9:35003870-35003883GAATAATTAATTA-7.12
MyogMA0500.1chr9:35003434-35003445CTGCAGCTGTT-6.02
POU4F2MA0683.1chr9:35003868-35003884ACGAATAATTAATTAA+6.56
POU4F3MA0791.1chr9:35003868-35003884ACGAATAATTAATTAA+6.15
POU6F1MA0628.1chr9:35003875-35003885ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr9:35003875-35003885ATTAATTAAT-6.02
Tcf12MA0521.1chr9:35003434-35003445CTGCAGCTGTT-6.62
USF1MA0093.2chr9:35003696-35003707GGTCACGTGGC-6.62
USF2MA0526.2chr9:35003693-35003709CGAGGTCACGTGGCAT+6.44
ZNF384MA1125.1chr9:35003233-35003245AAAAAAAAAAAA+6.22
ZNF384MA1125.1chr9:35003234-35003246AAAAAAAAAAAA+6.22
ZNF384MA1125.1chr9:35003235-35003247AAAAAAAAAAAA+6.22
Enhancer Sequence
ATTACAAAGA TACTGTTCAT TTTCCACAAA TAAACCTTTT AATTAAAAGA AAAAAAATGA 60
ATTTACAAAA AAAAAAAAAA CACGTGACTA AATAAAGGAA GATGGCCTCT CAACGACACC 120
TGCAGTTCCC CTTAAAATAT CACGACATAA TTTTGTATAG TTTTTCATAA CCTCCCTCCA 180
CCACCCTGCC TGATCTCACC ATCTTCTCAA TTTTAGCTCA AGCAATCAGC CTGCCACTCT 240
ATTGTAAACA AAACCATGTG ATGCAACCTG CAGCTGTTTT ATTCAACTTA TCTCTATACA 300
TGGGAGGACA AATTGGATTG ACAGGCGGCA TAATGGCATG TCCCTGCCCT ATTCACTCTT 360
ACCGCGCGTG GACAAAACGT CTGGGCTGAT GAGTTCTTGA TAGCATTTGG TGGCTCCTTT 420
GTGTACTCCA GCTCATCTCC AAAAGTCAAT TAAAATCCTG TGATGTTGAC ACCGCCAGCA 480
CGCGCCCCTA TCAAATACAA GTGCGACTCG CGTGAACCCG CGCTCTCGAG GTCACGTGGC 540
ATTACGCAAC AGGTCGGGTG ATTAAATTAA ATGATGTGCG CGAGCTTCTG AATCGTTTAC 600
GCAAATCGGC TCGTTTCAGC AATTGTTATG TCACAAATGC ATGTCAAAAT ACAGTCAGTG 660
TAACAATTAT TTATGCTCGA AAAGCACATT TACTCTATTT CACGAATAAT TAATTAATTA 720
TTATAATCAC AATTACGGGT AGCACGATCG CCTCACAGCA AGGTCACTGG TTCGAGGCTC 780
GGTAGGGTCA GTTGGCGTTT CTGTGTGAAG TTTGCATGTT CTCCCCATGT TTGCGCGGGT 840
TTCATCCGGG TGCTCCGGTT TCCCTCAACA AGTCCAAAAA CATGCTTTAG GTGAATTGGG 900
TAGGCTAAAT TGTCTGTA 918