EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-36633 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr9:23675247-23676475 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
HOXD9MA0913.2chr9:23676255-23676265GTTTTATTGC-6.02
RESTMA0138.2chr9:23675517-23675538GGAGCTGTCCGTGGTGCTGAA-11.64
TCF4MA0830.1chr9:23676293-23676303AGCAGGTGCG-6.02
Enhancer Sequence
CCTTGTGTTA AGTTCCTACA GCGATATTTA CCGATAGCTG GTCTTTTGTA AATAATCAGA 60
TAAAAAGAGA TGATAAAATT AATGGATACA AATGAAGATG TCTAACCCAG TAGTACATTA 120
TTGCTGAAAT ACACCATTGT ATCACACTAT ATTAACACGG TCAGGCTTGA ATACGATCGG 180
CGTGCGATCA GATAATGATT GGTTTGCTCT ACCTTGTGAC TGTTATCCAG CAACTAAACT 240
AGCTTTCTAA ACATCTGCGC GGGTGCTGCT GGAGCTGTCC GTGGTGCTGA AACTACGCCG 300
GATGTCATTC ACTGATGAAA TCACTATACC CTGATGAATA TATGCCACAT ACACTTTTCC 360
ACATCCTTCG CCTCTGTTCC TCCAAAACAA ATTTATATGT CAGATGGGAC TGGCTTCTGA 420
TGCATTTGGA GCTCAACCAG TGTTTGTTTT GGAAAATGAG GGACGCGTGG TAAAGGAGGG 480
CGCGCGCTGT GTAAGTGTGC GCGCGCGTTC CAGGGATGAC GATGACGGTG TTTGGGGAGC 540
TGTGGGTGTC TTTAAGAGCT TCTTTCTGCT CACTGCTGTC AGGATAGAGA GGCACGCGCC 600
ACCGAAGTAC TCACGAGAGC AGAGAGACGC GAGAGTCCTG TTGGAAATAC GTTTATCTTC 660
ATACACATCT AGGATATACT GTCTTCGGGA AACGTGGAGA ACATGCAGTT GCCAAAGTCA 720
CGCGCTTTCG CTGTCAGTCT GACGCTTCTA TCCGTCCTCA GCTCGGCAAT GTGCGGCAGT 780
CAGTGTGAGT ACCTGCAGTG CCTTTCAGCG TTGTGTTAAA AGTTGCTTTG GCTTGTGTTT 840
TTTTTTGTTT TTGTTTTTGT TATTCTGTTA ATGATTTCGT AACAGTGACC TGACCGGTAT 900
AATTATTGAA AAAAAGTGCA GGGGTTTAAA TTCGATTACT GTTAATATGA ACTTTTGCCA 960
GATCTGATGA ACGCGTACCT ATGCACAATG AATGACTGGT GCATTCGCGT TTTATTGCAA 1020
TTTCTTCTGA GCATCTGCTG GACAGAAGCA GGTGCGAGAC AAAGCATTCA GATGTGGTTT 1080
CTGTATTAGA GAAATTGAAG CCCAGATAGC AGTTTTGATT AAATATGTGA AGACGCGATG 1140
ATGATGCTAT ATTTCTCAAC GCATGCAACA TTTTTAGTGC TTCATTTATA GTCATATATA 1200
TCGCCAACAA AAACACAAAC CTATATAA 1228